|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1512 | VNG1980 | hla1665 | HQ3089A | Hut1802 | NP2324A | Hmu2425 | rrnAC3253 | HVO_1989 | Hbo1865 |
1033 | VNG1980 | 1484 | 908 | 737 | 830 | 849 | 920 | 963 | 949 | 985 |
1078 | hla1665 | 908 | 1599 | 822 | 859 | 907 | 981 | 995 | 997 | 1030 |
1014 | HQ3089A | 737 | 822 | 1454 | 763 | 780 | 860 | 918 | 999 | 1005 |
1064 | Hut1802 | 830 | 859 | 763 | 1488 | 855 | 948 | 1019 | 946 | 930 |
1096 | NP2324A | 849 | 907 | 780 | 855 | 1515 | 912 | 990 | 1051 | 1031 |
1193 | Hmu2425 | 920 | 981 | 860 | 948 | 912 | 1514 | 1196 | 1117 | 1095 |
1319 | rrnAC3253 | 963 | 995 | 918 | 1019 | 990 | 1196 | 1505 | 1229 | 1223 |
1316 | HVO_1989 | 949 | 997 | 999 | 946 | 1051 | 1117 | 1229 | 1504 | 1291 |
1357 | Hbo1865 | 985 | 1030 | 1005 | 930 | 1031 | 1095 | 1223 | 1291 | 1506 |
209 symbols consensus MRQFVVIGHDAPTTPD-FSLDDLAGAAGRLDVLCRCVNSAFFLSHGIREDVRVHLVLGDE #oth ..11223.122112.2132.3.11.2.....2.1.12311223..21.13.113.11211 VNG1980 ::::::L:::::::::::P::::P:::::::::::::SA:L:V:::::D::E:F:::::: hla1665 ::::::::::V::D::AI::S:IP:-:::::L:::::AAGV::::::::R::::::VA:: HQ3089A ::R--TG:F-----:N:--::::::G:::::I:::::T::LAC::::::::::::::NNQ Hut1802 :::::::::E::::::::P:E::P:::::::L:S:SITA::LR:::L:::::FR:I:::: NP2324A ::::I:::::V::D::AV::A::P:-::::::::::L::::::::DL:DN:::W::V::: Hmu2425 :::::I:::::::::::::::::::::::::::::::SA:V::::D:::::::::::::: rrnAC3253 :::::I:::::::::E:::::::::::::::::::::T:::::::A:::::::::I:::: HVO_1989 ::::I:T:::::::::::::::I::G:::::::::::::::::::D:::::::::::::: Hbo1865 :::::I:::::::::E:::::::::G:::::::::::::::::::A:::S:::::::::: consensus FTVRFEGAELRRLNPDERSTAALIRGALEAREEAIGHMPAESSPGVSIRRRGFEATLDDV #oth 21222124612311....11.11215..25223...1221341..132322123331342 VNG1980 V:::IDAGAVQYMH::::NV:G:LKQ::D:KT:::::QE:S::::IHVSK:::::V::A: hla1665 :::T:DADS::H:H::::NV::R::D::D:QDD:::::::DV::::EL::M:L:::::R: HQ3089A :::Q:D::N:K::::::::::::::T:::N::K:::::::::T:::::::M::AE:VNRL Hut1802 ::L:::::K:QG::::::::::RV:S:::Q::G::::QAV:T:::IYLA:::V::A:R:A NP2324A YAI::::S:::::::::::::::V::::A:::K:::S:A:NP::::Y::TQSLSGL:ES: Hmu2425 Y::TVDSETV:::::::::::::::T:::E:::::::I:V:T:::I:LT:::::G::E:: rrnAC3253 Y::T:::SD::::::::::::::::K:::E:::::::I:V:T:::::LT:::::G::::: HVO_1989 Y::::::S:::::::::::::::::K:::K::::::::::::::::::::M:::T::EEA Hbo1865 ::::::::::::::::::::::::::::DV:::::::::::A::::::::M::D::::A: consensus ---------ATDGTVVQLHEDGDPIVDVAPPADPVFVLSDHHDFTDEEAALLADAADERV #oth 11111111136431223..12.31314331243.2......211342.432.22422312 VNG1980 :::::::::--S:P::A::::::ALAA:D:L::::::::::R:::AA::S:::::S:H:: hla1665 LDTPGTSSASA:P:L:::::::::L::A:::T:::::::::N::APA:RD::::R:ER:: HQ3089A :::::::::K:ET:PI::::T:T::::ID::D::L:::::::SL:ND:IEQ:G:I:EHQI Hut1802 ::::::::::EE::LL::::::R:::ER:V:D:::::::::R:::E::Q:::DELNA::: NP2324A ::::::::::D::PL:T:::::Q:V::ID:S:E:T:::::::S:D:A:T::::AH::R:: Hmu2425 :::::::::::A:::::::A::::A::AT::TG::::::::R::::::QD::D::::Q:L rrnAC3253 ::::::::::RR::::::::::::::G::::S::::::::::::R:::::::::R::::: HVO_1989 ::::::::::S:A:::E:::::::V:Q:E::EN:L::::::::::::::E:::A:::::: Hbo1865 :::::::::::::::IE:::N:::VA::E::E::::::::::::::D:::A::::::::: consensus RLGPEALHADHAITVAHNYLDTDGYERY- #oth 11..541..1.21111..3...2.14311 VNG1980 :V::TV::::::::::::H:::A:FDA:: hla1665 :V:::L:::::TVS:V::W:::::::S:: HQ3089A ::::MI::::::::I:::::::N::NQ:: Hut1802 S:::N:I::::::S:V::::::::::::: NP2324A S::::P:::::::::::::::::::N::: Hmu2425 S:::QP:::N::::::::F::::::RSDE rrnAC3253 S:::K::::::S::::::::::A:F:::: HVO_1989 :::::I:::::S::::::::::A::S::: Hbo1865 :::::V:::::S::::::::::::FSS::