| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4248 | NP2160A | VNG0947 | HVO_1218 | Hbo0339 | hla0718 | Hut1656 | rrnAC2183 | Hmu0425 |
| 2816 | NP2160A | 4249 | 2235 | 2412 | 2420 | 2332 | 2405 | 2455 | 2488 |
| 2755 | VNG0947 | 2235 | 4280 | 2266 | 2304 | 2205 | 2469 | 2433 | 2508 |
| 3075 | HVO_1218 | 2412 | 2266 | 4254 | 3470 | 2374 | 2446 | 2475 | 2495 |
| 3145 | Hbo0339 | 2420 | 2304 | 3470 | 4259 | 2399 | 2466 | 2505 | 2472 |
| 2932 | hla0718 | 2332 | 2205 | 2374 | 2399 | 4283 | 2462 | 2537 | 2551 |
| 3232 | Hut1656 | 2405 | 2469 | 2446 | 2466 | 2462 | 4280 | 3175 | 3095 |
| 3396 | rrnAC2183 | 2455 | 2433 | 2475 | 2505 | 2537 | 3175 | 4312 | 3485 |
| 3340 | Hmu0425 | 2488 | 2508 | 2495 | 2472 | 2551 | 3095 | 3485 | 4313 |
592 symbols consensus ---MASGE----AESTLDLTISEFIDSLLESYRRMPIPLRRYLLFVLLPAIVFFLASIVG #oth 1222254111114446344244334522311.231513352.2342.3.1332.241423 NP2160A ::::GVA:::::----RSAQLTDLVG:I:DA:D::EMDAKT:V:A::::TT:L::G:::L VNG0947 MAAE:E::HVESEG:LS:VDFG::VE:VV::::T::M:AF::VA:A:V::V:::FVT::A HVO_1218 :::::GEQ::::ST:MQAVQVRD::SDII:::EQ::ME:P::::A::G:::::::L:VA: Hbo0339 MSEAST::::::EFG:QTKQVRA:L::V::::E:::M:I:::G:V:::::V:::I::LA: hla0718 :::::VK:::::VGNG:A-:AA:LTSAVM:::DKLD:SK:K:VG:::I:::LV::::V:: Hut1656 ::::::E:::::--A:::::::GT:A:::::::::G::IQ:::FGI::::F:::::TLGV rrnAC2183 :::::Q:::::::::D:::::::T:Q::V::::Q:T:::E:::FLI::::VG::II:T:V Hmu0425 ::::::N:::::::NS:N::L::IF:D::DA::Q:H:::Q:::F:I:::::A:::L:A:A consensus ALALPLPLLVRIPIPLLGALLLGAAVFYPKILLSQRRRELENRFHLLITHMTVLSTTNID #oth 23225214432313111.413132114..124322325622111..32......1..1.. NP2160A ::VWQTI::::LLF:::::V::::G:A:::LAMD:::I:M:::::::V:::::::::::: VNG0947 IV::S::TYLL::T:M::L:A:I:::M::::RMD:::TRM::::::F::::::::::::: HVO_1218 :I:::::::::::VF:::V::::G::L::RL:VE:T::S:::QL:::::::::::::::: Hbo0339 :I::::::::::::F:::::M:IG::L::RL:VEEQ::G:::QL:::::::::::::::: hla0718 LFV::::FAA:V:V:MF:G:V:VS::I::::Y::SLENKID:QL::VM:::::::::::: Hut1656 ::LVN:::GIKL:F::::L::::::::::RVQ::::KQA:ND::::MV:::::::::K:: rrnAC2183 ::L:EQ:IA::A::::::F:VMAS:I::::::::::K:::N:::::::::::::A::K:: Hmu0425 ::V:D::MMI:A:::M::F:AMA::I::::::I::::SQ:N::::::V::::::A::K:: consensus RMEVFRTLAKEEEYGELAEEMRRIVQLVDTWNQSLDDACRRRAKEVPSDALADFLDRLAY #oth .12...4125.1...2125.24.112.1.1..1.....121..32...3332.11...1. NP2160A ::::::K:S::::::::TV:::::::::::::::::::L::::::::::S:T:LF::::: VNG0947 :V::::RIGA:::::P:S::A::::::I:A::::::::::M::NK::::LI::::::::: HVO_1218 :VA::::::R::::::::T::N:::::::A:::::::::Q:::R::::KP:::::::::: Hbo0339 :VS:::Q:G:::::::::I:::::TE:::::::::::::E:::RQ:::KP:::::::::: hla0718 :::::::::::::::VA:::IA:V:H:::::::::::::::::E::::::M:::F:::G: Hut1656 ::::::A::S:D::::::T::G:V:E::::::L:::::::::::::::::::::F::::: rrnAC2183 :::::::::E:D::::::M::H::::::::::L:::::::::::Q:::R:VS::F::::: Hmu0425 :::::::::Q::::::::N::H:::E::::::::::::::::::::::A:VS:::::::: consensus TLGAGQSLEDFLLSEQEAIIQNYITVYESSLGNLEVMKDLYLSMILSMTFALVFAVVLPI #oth 1221.132221.33..431232.5.3.223.3111......1..1..1...211.2...1 NP2160A ::::::EMS:::FE::GVM:E::K:I:QQ::E::D:::::::::V::::::::::::::: VNG0947 :INS:E:::SY:M:::::::R::A:T::GQ:E:I::::::::::V::V:::::::T:::: HVO_1218 SIN::::ID::::G::N:M::K:::::::A:::::::::::::::::::::IIN:I:::: Hbo0339 S:S:::DID::::G::S:MV:K:::::::A:::::::::::::::::::::VIN:I:::: hla0718 :M:::::::E::V:::DVMLAK:E:L:::::S:::::::::M:::::::::::::I:::: Hut1656 :M::::::::Y:::::DM::E::K:I::GT:::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC2183 ::::::G:D:Y::T:::Q:::H:S:::K:::DS::::::::::::::::::::::::::V Hmu0425 ::::::::::Y::::::Q:::::T::::GT:D::::::::::::V::::::::::::::V consensus LTGTDPTMTVSAVIVLFVFVQLGFYLAIRSMAPYDPLWYHPEEYRTPAERRLNISLYAGV #oth .1111113.12..11112.1.3..24312222.2..2.1324232245352254243412 NP2160A ::A:N::W::A:::AM:::::V::F:V::ALV:H:::::IE:G:::RSKQK:VG:SVLA: VNG0947 :S:::::::::::V::YT:I:V::LYTMYTL::S:::::F::DRT:SV:W:MRVATA::S HVO_1218 :::::A:::IG::::::::::::::FV::T:S:H::::::QR::::K:N:QID:T::GA: Hbo0339 :::::A:L:IA::::::::::::::YV:KT:S:::::::VQS::::K:D:QID:A::GA: hla0718 :::N:::A::A::::::::::::::AM::ATS::::I:F::D:-:A:GDLK:WA::GI:G Hut1656 ::::N:M::::::::::I:::T::FV::::L:::::V::::::ITS:M:::::V:FA::: rrnAC2183 ::::N::::::::::M:::::T::::::::::::::V:F::V::PS:I:SK::K:MV::: Hmu0425 :::::::::::::::MYI:::S::::::::::::::V:F::DD:PSDV:N:IEKAT:V:: consensus GLSLVLVFILAAGMFGISPIGLDDLLFMLD-VPLPLYAAAPITPLLIPGIVARREEQRIK #oth 2135232314422422531435635443435312121224.22.22111223.32.3213 NP2160A V:F:LI:LVMT:SS::VA:F---:S:VPMASI:T:::L:I:TL:F:::A::F::Q:KA:I VNG0947 VAAV:::VVVI:VQLSWT:LAP:V------:L:::M:::V:T:::::::L:::A::G:V: HVO_1218 :::ITM:LV::L:T:NLT:V:ATVRPI:IE:L:I::LIST:L:::AV:::::::H:K::G Hbo0339 A::F:::G:::L:TA:FTS::QSVQSV::::T:I::LI:::L:::A::::I:::H:N::: hla0718 :::FLIIG:T::::::YG:-::PG::WFI:D:R::::L:V::S::F:T:V:L:S:::A:T Hut1656 V:T::FG::SFG:FA:::::T::MIF:FW:P:::SI::VF:::::::::LII:Q::KK:: rrnAC2183 :::ML::::TLG::L::::VT:N::F::::G:::::::::::::M:::::AF:Q:::::: Hmu0425 A:TA::I::SLG::::V:::TVG::::F::R:::SM:::I:::::::::::I:Q:::::: consensus ERDEEFPSFIRALGASEGAKQSTTTAVLKTLRDKDFGALSPNIDRLYKRLNMRIEPERAW #oth 3..42112......11.2.1.1..24..31.13.2..3.123122..3..11.142451. NP2160A :::::::::::::::::S::::::ST::::::K::::::T::V:D::R::::::NT:::: VNG0947 D::DA:T:::::::S::T:R:T:::R::E:::::N::::TEL::D::::::L:LDASQ:: HVO_1218 :::::Y:G:::::::::T:::::::::::::KT::::V::RE:A:::T::R::LD:D:S: Hbo0339 :::::Y:G:::::::::S::::::::::::::T::::V::RE:::::V::::::G:T:S: hla0718 A::G:::::::::::T:S:::::::D::T:::::N::D:::S:E:::R::::::ST:G:: Hut1656 A::Q:Y::::::::ST::::::::G:::ES::E:E::P::E:::N::::::::::::K:: rrnAC2183 D::S:::N:::::::T::::::::G:::R:::K:::::::::::N:::::::::::TS:: Hmu0425 G::DQ::::::::::T::::::::SM::R:::E:::::::::V:D:::::::::::AE:: consensus RFFTADTRSYLIQKFSEMYLIGRQMGGSPKQLGELISENMNEVLQLRQQRRQAATTLIGL #oth 23.12133..11.1.....11..3...5..3.....14..12252..31.5.313.11.1 NP2160A :Y:AE::N::I::::::::::::S:::N::M:::::::::::LC:::E::::VTV::::: VNG0947 :H::::SH:::::::::::::::::::A::H:::::::::S:::::::::S:S:S::V:V HVO_1218 F::::E:N:::V:::::::NV::S:::K::L::::::R::::IIK::R::K:STV::::V Hbo0339 F::::EAS:::::::::::N:::::::T:::::::::S::::IVK::R::E::TV::::V hla0718 EQ::Y:::::::::::::::V::::::D::M::::::K:::A:N:::E::::::M:F::: Hut1656 :H:::ES::::::T:::::::::K::::::::::::::::::::::::::D:ET:::::V rrnAC2183 ::::::C::::::T:::::::::E:::::::::::::::::Q::::::K:K::::::V:: Hmu0425 :Y::::C::::::T:::::::::E::::::L:::::AA::::IQA::T::N::::::::: consensus LYGITAAATFAFFIGLEVVNILASMSLNLSLGS--FDFGQLINTGVYDIPLIEYLLILII #oth ...11.112....1..211412132323233431322322122222.21131211.4222 NP2160A ::::S::SA::::T:::IAI:M:GFD:EMGTAQ::::::::LH:EM:NV::LR:::L:V: VNG0947 ::::S:::::::::::GI:DVISGLG:DF:NPA::::V:SI:::E::::ET:K:::V:TL HVO_1218 ::::::S:S::::::::::E::::F:TEMN:D:::LQ::T::YA::::V:F:::M:T::: Hbo0339 ::::::S:S::::::::::E::::F:TKMN::Q::MQ:::::YA::::::::::::A::: hla0718 :::::::::::::::::I:A:::DLTADFQ:DE::M:I::IVYP:A::::::::::LTVV Hut1656 ::::S:::::::::::Q:::::SE:::::QT::SN:EVST::H:S::E::I::F:::TV: rrnAC2183 :::M:::S::::::::Q::::::D::::::T:::RL:AAS::::S::N:::::F:::I:: Hmu0425 :::::::S::::::::Q:::::S:::::::SNA:G::AST::::S::N:::::F:::I:: consensus LFNALLSSLMIRTVDGGHKANAYLHFVVLVWIGAATAIATKSLVSALISI-- #oth 211.31.1112.33...133.312...3.3.21244242.441243313111 NP2160A ::::VM:A:T::VA::::YG::F::::A:::V:CM::F::E::I:M:LD:DL VNG0947 :I::S:::::T:V::::::V:::I:::A:T::SCVIGSV:LE::KS:L:V:: HVO_1218 ::::::::::::M::::::::::::::M:::V:SLM:V::S::AG::::V:: Hbo0339 ::::::::::::M::::::::::::::::::::C:S:V::S::AG::::V:: hla0718 ::::S:::Q:::RI:::NP::G:I:::L:T:L::::::::RT::N:ILT::: Hut1656 I::::::::::::T:::::L:S:M:::::S::::LV::F::LV::SV::::: rrnAC2183 M:G:M:::::::::::::N::T:M:::::S::::I:GTF::W:::QFL:::: Hmu0425 M:G:M::A::V::::::::G:T:M:::L:A:::SV:S::::W::TQF:G:::