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[K] (SPT15) COG2101 TATA-box binding protein (TBP), component of TFIID and TFIIIB
9 genomes BUD0044 13 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG2243

rrnAC0681

HVO_0158

HVO_1727

Hbo1282

Hbo3094

Hmu3142

Hut1951

hla0660

hla1728

NP1064A

HQ2527A

HQ3410A

Pairwise sequence scores
Consensus score1381 hla1728 HQ2527A Hbo3094 HVO_1727 hla0660 HQ3410A HVO_0158 Hbo1282 rrnAC0681 VNG2243 Hmu3142 Hut1951 NP1064A
1116hla1728 1369 1268 1274 1274 1052 1030 1081 1079 1069 1048 1045 1058 1068
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1105HVO_1727 1274 1239 1288 1376 1030 1031 1081 1074 1071 1039 1042 1030 1043
1186hla0660 1052 1022 1037 1030 1358 1119 1180 1143 1127 1126 1152 1139 1146
1233HQ3410A 1030 993 1009 1031 1119 1374 1227 1202 1132 1180 1189 1181 1203
1292HVO_0158 1081 1068 1086 1081 1180 1227 1390 1272 1201 1238 1221 1228 1247
1273Hbo1282 1079 1047 1065 1074 1143 1202 1272 1389 1174 1206 1213 1209 1226
1243rrnAC0681 1069 1047 1074 1071 1127 1132 1201 1174 1366 1218 1273 1221 1235
1283VNG2243 1048 1027 1061 1039 1126 1180 1238 1206 1218 1371 1282 1265 1282
1298Hmu3142 1045 1041 1050 1042 1152 1189 1221 1213 1273 1282 1376 1318 1317
1287Hut1951 1058 1033 1046 1030 1139 1181 1228 1209 1221 1265 1318 1368 1334
1309NP1064A 1068 1041 1065 1043 1146 1203 1247 1226 1235 1282 1317 1334 1382

189 symbols
consensus       MTDPKDTINIENVVASTGIGQELDLQSVAMDLEGADYDPEQFPGLVYRTQDPKSAALIFR
#oth            .33.111.3.1..............111.2..1...11.11........12..1......
hla1728         ::N:A:S:E:Q::::::::::::::EAL:E::P:::FN:DN:::::::::E::A::::::
HQ2527A         :SA:A:S:E:Q::::::::::::::EAL:E::P:::FN:DN:::::::::E::A::::::
Hbo3094         :SA:A:S:E:Q::::::::::::::EAL:D::P:::FN:DN::::::::::::A::::::
HVO_1727        :SG:A:S:E:Q::::::::::::::EAL:D::P:::FN:DN::::::::::::A::::::
hla0660         :::::E::T::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T::::::::::
HQ3410A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::K:::::::::
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Hbo1282         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::::::
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Hmu3142         :V:::E::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hut1951         :V:::E::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::::::
NP1064A         :Q:::E::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::::::::

consensus       SGKIVCTGAKSTDDVHESLRIVFDKLRDLQIPVDDDPEITVQNIVTSADLGRNLNLNAIA
#oth            .........1.121.121.511.21..3.5.21222.1.1.....1.....34.....1.
hla1728         :::::::::::I:::::A:G:I:E:::G:::::EE::::::::::S:::::H::::::L:
HQ2527A         :::::::::::IN:::DA:G:I:E:::G:S::::E::::::::::S:::::HT:::::L:
Hbo3094         :::::::::::I:::::A:G:I:::::G:S::::E::::::::::S:::::H::::::L:
HVO_1727        :::::::::::I::::DA:G:I:::::E:K:::::E:::::::::S:::::H::::::L:
hla0660         :::::::::N:I:A:::::A::::E::G::::I:-::::::::::::::::ES:::::::
HQ3410A         ::::::::::::T::R:::H:::::::::R:::S:N:D:::::::::::::ED:::::::
HVO_0158        :::::::::::::::::::E:::::::E:::::::::::::::::::::::E::::::::
Hbo1282         :::::::::::::::::::NL::::::A:::::::E:D::::::::::::::::::::::
rrnAC0681       ::::::::::::::::Q::::::::::::N:Q:::::::V:::::S:::::SS:::::::
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Hut1951         :::::::::::::::::::::::G:::::E:Q::E::::V::::::::::::::::::::
NP1064A         :::::::::::::::::::::::::::::E:Q::E::::V::::::::::::::::::::

consensus       IGLGLENIEYEPEQFPGLVYRLDEPDVVALLFGSGKLVITGGKEPDDAEEAVDEIVSRLE
#oth            ......21.............2.4.4..1.......1.1...1425..35..13.32112
hla1728         ::::::DV:::::::::::::M:::E::I:::::::I::::::RT:::::::E:::E:I:
HQ2527A         ::::::DV:::::::::::::M:Q:E::I:::::::I::::::QTN::AA::E:::E:I:
Hbo3094         ::::::DV:::::::::::::M:::E::I:::::::I::::::QTN:::T::E:::K:ID
HVO_1727        ::::::DV:::::::::::::M:::K::I:::::::I::::::RT::::T::E:::E:ID
hla0660         ::::::H::::::::::::::I::::::::::::::::::::TS::::AA:::V::EK:D
HQ3410A         :::::::::::::::::::::::N:A::::::::::::::::::::::R::::V:L:::D
HVO_0158        :::::::::::::::::::::::::S:::::::::::::::::Q:T:::A:::V:I:::S
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VNG2243         :::::::::::::::::::::::D:E:::::::::::::::::::K:::H:::K:T::::
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Hut1951         :::::::::::::::::::::::D::::::::::::::::::::::::KK:::K::::::
NP1064A         :::::::::::::::::::::::D::::::::::::::::::::::::R::::K::::::

consensus       ELGLLD---
#oth            4...24111
hla1728         G::::G:::
HQ2527A         D::::N:::
Hbo3094         N::::::::
HVO_1727        A::::G:::
hla0660         G::::A:::
HQ3410A         ::::AG:::
HVO_0158        :::::NGSF
Hbo1282         D:::YGG::
rrnAC0681       D::::::::
VNG2243         :::::::::
Hmu3142         D::::E:::
Hut1951         :::::E:::
NP1064A         ::::::G::