Home |  Text search
[S] (-) COG2259 Predicted membrane protein
8 genomes BUD0782 16 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG2413

pNG6041

pNG6051

rrnAC0784

HVO_0763

HVO_0917

HVO_1757

HVO_A0548

Hbo1255

Hmu0284

Hmu1399

Hut1942

hla0436

hla2300

hla2376

NP6076A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score1303 Hut1942 HVO_0917 pNG6041 VNG2413 hla2300 rrnAC0784 Hmu0284 Hmu1399 hla2376 pNG6051 hla0436 NP6076A Hbo1255 HVO_1757 HVO_0763 HVO_A0548
460Hut1942 1596 628 245 297 394 302 323 322 281 366 384 349 314 364 355 382
477HVO_0917 628 1362 274 306 285 263 240 242 330 407 427 344 397 411 470 488
601pNG6041 245 274 1352 416 414 413 392 390 371 365 427 557 448 463 445 464
704VNG2413 297 306 416 1322 712 666 721 715 326 368 399 547 510 450 448 463
809hla2300 394 285 414 712 1348 932 1032 1030 377 425 383 582 482 503 479 501
762rrnAC0784 302 263 413 666 932 1544 1018 1023 279 375 356 559 462 547 477 508
827Hmu0284 323 240 392 721 1032 1018 1335 1329 348 369 379 583 470 517 453 493
825Hmu1399 322 242 390 715 1030 1023 1329 1334 346 367 377 588 475 519 455 495
567hla2376 281 330 371 326 377 279 348 346 1341 634 640 365 483 446 449 437
619pNG6051 366 407 365 368 425 375 369 367 634 1413 926 482 619 540 605 609
607hla0436 384 427 427 399 383 356 379 377 640 926 1385 461 523 486 510 519
749NP6076A 349 344 557 547 582 559 583 588 365 482 461 1405 602 641 581 604
809Hbo1255 314 397 448 510 482 462 470 475 483 619 523 602 1383 748 858 856
854HVO_1757 364 411 463 450 503 547 517 519 446 540 486 641 748 1343 864 957
841HVO_0763 355 470 445 448 479 477 453 455 449 605 510 581 858 864 1237 1213
878HVO_A0548 382 488 464 463 501 508 493 495 437 609 519 604 856 957 1213 1328

236 symbols
consensus       --------------------MATNTTN------PLGGDVEFDLSGTWTGYWLALLRLITG
#oth            1111111111122221222234587973345669556767466636273232343.243.
Hut1942         :::::::::::MELAVYVPFE:LRM:TRELDAELF:RA:S:RY:E::I::S:LS::::M:
HVO_0917        ::::::::::::::::::::-------::::::-----:R::Y:ER:V::S:F:::VVM:
pNG6041         :::::::::::::::::::::S:QSIR::::TNF::TETS:SV::A:LS::IL::::TA:
VNG2413         :::::::::::::::::::::GY::RA::::::GTESGAGYGAA:::PA::I:VV:VL::
hla2300         :::::::::::::::::::::SYQSS:::::::::V:E:::A:D:P:AA::I:F::VV::
rrnAC0784       MGFHSVGTPSPLYATVVRNSICEV:QMSYQAAN::AD:F:LK:G:A::A::::F::VV::
Hmu0284         :::::::::::::::::::::::::A:::::::::AT:F:LE:D:PL:S:::::::V:::
Hmu1399         :::::::::::::::::::::::::A:::::::::AT:F:LE:D:PL:S:::::::V:::
hla2376         :::::::::::::::::::::S:K:::::EFGGEI::VTILGKAHSLSALFIV:::ATI:
pNG6051         :::::::::::::::::::::S:LDSGMNQLESRV::LTVGGKVHSLSAWFVLA:::MM:
hla0436         :::::::::::::::::::::S:QEVA:::LRSTI::VSVEGRLH:LSVWFILA:::MI:
NP6076A         :::::::::::::::::::::::QNKR::TTTKLF:RG:SYGT::Q:NS:::LF:::VM:
Hbo1255         :::::::::::::::::::::S:P::T::TTDTKFDDVLN:::Q::LA::::VAV:::::
HVO_1757        ::::::::::::::::::::::ATGEI:::::EM::NRM:::YAEGV:::V:VFA::V::
HVO_0763        ::::::::::::::::::::-------::::::-----MD::Y:RGV:::V:V:T:::::
HVO_A0548       ::::::::::::::::::::::A:SQI:::::EM::NRMD::Y:RGV:::V:V:T:::::

consensus       WWFFHAGLTKIV-------GEPFSAAGYLMN--GMAG--TPLAGIFAW--------MGAN
#oth            333242.44.46111123557624353337744535422342624845111111114275
Hut1942         :T::Y::I::VL:::::::NPEW:VR:F:TYSI:PENPLSN:::YNI:DIMATGEIL:TG
HVO_0917        :TL:QG:I::L:TYLDSDPSNNWT:::::A::AIPE:::N::M:LWSS:::::::::AGS
pNG6041         ::ML::::D::W:::::::AW::D:SWFVGG::AAQ::::I::PFVTP::::::::FSDG
VNG2413         :::::::F::LL:::::EG:LT:DPS:::Q-:::::::::V::PVGTT::::::::LAGY
hla2300         :::::S:I:::I:::::ES:FSY:YGAMY:Q::::SD:::A:G::PV:::::::::::N:
rrnAC0784       :::::::V::LI:::::ED:LAY:YGPMYLK::Q:T::::A:GP:PVL::::::::::EH
Hmu0284         :::::::V::L::::::ED:LAY:YGPMY:Q::E:T::::A:GP:PV:::::::::::N:
Hmu1399         :::::::V::L::::::ED:LAY:YGPMY:Q::E:T::::A:GP:PV:::::::::::N:
hla2376         GMILF:::G:VS:::::::EW::D:::::VHGVDA:-::S:VS:LY:A:::::::::AS:
pNG6051         YA:AYS:F:::T:::::::-GE:A:G:::S:VAATN:::N::::L:::::::::::::ST
hla0436         LA::QS::D:VL:::::::SGE:::V:::Q:APAAN:::S:A::L::A::::::::::ES
NP6076A         ::::SS::S::::::::EY:VLYD:H:WM:F:::TE::::IVYP:T::::::::::FA::
Hbo1255         Y::L:::WN:FA::::FVS::S:D:::::L::::TTA::S::H:F:::::::::::AA:T
HVO_1757        Y::L:::V::YL::::::GA:::N:::W:V::::T::APG:VHAFL::::::::::V:QT
HVO_0763        Y::L::::G::T:::::::::::::::::A:::AP:A::S::Q:F:::::::::::AA:T
HVO_A0548       Y::L:::V:::::::::::::::::::::A:::AP:A::S::Q:F:::::::::::AA:T

consensus       PALL--INVMVPLGETLIGLGLIVGALVRLAAFGGAVLMTFFY--------L--GNA-EW
#oth            364542565423522322.11132.421.21143.243.421111111111311134236
Hut1942         LYWYQLLTPLNQ::L::V::A::A::F::FS::W::LM:::YW:::::::::::AAF:PL
HVO_0917        :L--::TDMLNMW:L::A::A::L::F::FS::W:::M:L:YWAAALEGGI:::AGL:PL
pNG6041         -I::AFV::A::::Q:A::::::L:V:T:T:::F::FM:L:::::::::::FIN:YGGG:
VNG2413         :GI-:::GP::VIF::::::A::::L:T:F:S:::VMF::M:W::::::::I:::::::Y
hla2300         L:W::::EPG:::F::::::A::A::FT:::::::VIF::L:W::::::::V::::::GF
rrnAC0784       LGW::::QA:::::::::::::M::::::::SVF:VFF:SL:W::::::::I::::::GF
Hmu0284         L:W::::APG:::F::::::A:MA:L:T:::SI::VIF::L:W::::::::I:::::::F
Hmu1399         L:W::::APG:::F::::::A:MA:L:T:::SI::VIF::L:W::::::::I:::::::F
hla2376         A::MEFV::F::ATQL:::TA:::::F:::::L:::IQ::L::::::::::::::GWSGD
pNG6051         :WFVEFA::A::Y::LF:::::L:::F::::::F::LM:LM::::::::::F::::W:DM
hla0436         ALFIDFV::A::W::V:::::V:::L:T:::::W::FM:LM:::::::::::::::W:DI
NP6076A         AVW:::P:LLI:W:QL:::::::::C:T::::AN:::::F:::::::::::F::::::::
Hbo1255         :W:MEFT:F:I:T::F:::::::::G:::::S:F:::::V::::::::::::::::::D:
HVO_1757        :V::EFT:L:::::::::::::V:::A:::::A:::F:::::::::::::::::::::::
HVO_0763        :W::DLT:::I:W::F:::::::::::::::::F:G:::V::::::::::::::::::::
HVO_A0548       :W::DLT:::::W::F:::::::::::::::::F:G:::V::::::::::::::::::::

consensus       GHG-LVNGDLMGLLLFLTVIALGAGRILGLDAIIEKTE-----LVERRPKLRYLLG
#oth            332242233241432155332111.12212.322155422133334573334331.
Hut1942         EGSV:IDFHFVYV::LFGIG:F:T:::::::::::EHPVT:KPYLD:Y:W:NLF::
HVO_0917        A::WV:DDHIVYAV:LFGLG:F:::::::V::YL:NM::::::F:R:NRWMSLVM:
pNG6041         AN::M:T:E:L:IMV:G:IV:::::GV:AV:NRLREM:::::::F:N-TR::K:::
VNG2413         A:::V::S:F::::::T:I:VF::::YY:::S:V:R:D:::::::QGA:R:K::::
hla2300         :::::::S:F::::::V:M:V:A:::YY::::::::LD:::::V::QH::::::::
rrnAC0784       :::::::S:F::::::M:M:V:AT::YY:::::::::K:::::::K:H::::::::
Hmu0284         :::::::S::::::::::::V:::::YY:::::V:Q:K:::::::Q:H:::::I::
Hmu1399         :::::::S::::::::::::V:::::YY:::::V:Q:K:::::::K:H:::::I::
hla2376         ALA::FDST:VYAIV::::A:F::::V:::::Y::RF:VGGQA:::EF:A:::I::
pNG6051         ::::FI:::FAYM:V::A:A:FA::::::::QY::NYDVGGET::::Y:A:E:I::
hla0436         S:::YI:::FAYM:V::S:A:F::::::::::YV:QY:IGGQP::::Y:WT:::::
NP6076A         :N::F:::::F:::::::I:VFA:::VW:I::YL:G:N:::::Y:KN::::::I::
Hbo1255         A::::::::::::V::V::ATF::::::::::YL::FD:::::FAKTKAA-KFI::
HVO_1757        ::::::::::L::VM::V:G::AT::::::::YL:E:::::::F:RQ:::::::::
HVO_0763        ::::V:::::F::MM:VI:GT:A:::::::::::::M::::::F:RQ::A:K::::
HVO_A0548       ::::V:::::F::MM:VI:GT:A:::::::::::::M::::::F:RQ::A:K::::