|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 5205 | hla0487 | VNG0745 | HQ3000A | HVO_2846 | Hbo2612 | NP3450A | Hut1103 | rrnAC1070 | Hmu1629 |
3454 | hla0487 | 5358 | 2810 | 3075 | 3137 | 3121 | 2918 | 2806 | 2898 | 2607 |
3604 | VNG0745 | 2810 | 5138 | 3062 | 3042 | 3085 | 3301 | 3205 | 3207 | 2804 |
3897 | HQ3000A | 3075 | 3062 | 5255 | 3648 | 3925 | 3292 | 3201 | 3261 | 2841 |
3997 | HVO_2846 | 3137 | 3042 | 3648 | 5207 | 4007 | 3274 | 3143 | 3201 | 2819 |
4107 | Hbo2612 | 3121 | 3085 | 3925 | 4007 | 5218 | 3384 | 3260 | 3449 | 2995 |
3889 | NP3450A | 2918 | 3301 | 3292 | 3274 | 3384 | 5168 | 3363 | 3619 | 3059 |
3873 | Hut1103 | 2806 | 3205 | 3201 | 3143 | 3260 | 3363 | 5281 | 3707 | 3092 |
4097 | rrnAC1070 | 2898 | 3207 | 3261 | 3201 | 3449 | 3619 | 3707 | 5347 | 3624 |
3597 | Hmu1629 | 2607 | 2804 | 2841 | 2819 | 2995 | 3059 | 3092 | 3624 | 4790 |
713 symbols consensus ----MRRDRRAAQRVADRLDEPAREAGALARKLGLDPYPVNYWIVDHDEMNQLIAYGGFQ #oth 112344462662343166.331152.3211221.13122131122321111212112111 hla0487 ::::::DE:VE:K:E:ES:GV::A::R:::ER:::E::::R::::::::::E:::::::: VNG0745 :::::T:PDP:KHAA:QT::::::::N:::::::::::D:Q::V:::::::E::::D::: HQ3000A MSSRPI:F::R::AE::Q:E:::T::A:::K::::::::::::::G:::::::::::::: HVO_2846 ::MSF::H::D:::E:A:::::V:::::::K::::::::::::V:NY::::::::::::: Hbo2612 :::::::F:HT::K::GE:E:SV::::N:::::::K:::::::V:NY::::::::::::: NP3450A :::MTTN::FHK::::GQ:E:::H::N::::::::::FD:::::I:Y::::E:V:::::: Hut1103 ::MSPIEN:TD:KET:R::RD:VEK::E:::A:::::::::::::::::::::::::::: rrnAC1070 :::::NN::F:K:::::D::::VE:::N:::::::K::::::::::Y::::E:::::::: Hmu1629 ::::----------:GHG:RP::K-:::VP:RE:-------------------------- consensus RRYPHWRWGMTYDRQQKQDQFGGGKAFEIVNNDDPSHAFLQESNSLADQKAVITHVEAHA #oth 41111111116122131442223111.......1.11....1..32...........1.1 hla0487 ::::::::::N:E::S:L:RH:L::::::::::::::::::::::P:::::::::::::: VNG0745 T:::::::::K:EK:R::T::L::::::::::::::N::::V::D::::::::::::G:: HQ3000A ::::::::::::::::::::::M::::::::::::::::::::::::::::::::::G:: HVO_2846 E::::::::::::::R:T::::M::::::::::::AN::::::::::::::::::::::S Hbo2612 :::::::::::::::::K::::M::::::::::N:::::::::::::::::::::::::: NP3450A ::::::::::S::::R::R::L::::::::::::::N::::V::DM:::::::::::::: Hut1103 Q:::::::::A:::::::G::L:::::::::::N:A:::::::::M:::::::::::::: rrnAC1070 Q:::::::::Q:::::::G::L:::::::::::::A::::::::T::::::::::::::: Hmu1629 --------------------------:::::::N:A::::::::E::::::::::::::: consensus DFFANNEWFGLFADG---------------RGPDAAAMLERHADTIQEYMQDPDIDRDDV #oth ...3..4..2213344422221123233225523.111.2111211352422.113.331 hla0487 ::::::R::::Y::RGK:::::::::::::G::N:::R:::N::R:AAIADR:EV:::E: VNG0745 :::N::Q:::::::::::::::::::::::E:::::::::::::RVASFLS::E:G:ES: HQ3000A :::K::N::SR:SGD:::::::::::::::QEL:::::::::GE:::G:VD::::::::: HVO_2846 :::K::Q:::::S:E:::::::::::::::GQFA:::::::::Q::ER:V:N:::S:::: Hbo2612 :::S::::::M::GD:::::::::::::::SDL:::::::Q:GE:::K::D::::::E:: NP3450A :::K:::::R::D--:::::::::::::::TS:::::::::::E:VE::IS::::S:E:I Hut1103 ::::::::::::SH:VD::::::QRADPDR:::::T:::A::::R:R:F::::E:::GA: rrnAC1070 :::::::::RM:T::SSRTTTD:ESGEDRR::::::G::A::G::::::::::::E:AE: Hmu1629 ::::::D::::::G:AAPGAADSEDGQRRLSN:E:::::G:::E::E::::::E:::AE: consensus ERFIDAVLCLEDNIDQHRPYAPAEP-----------DPEEIDPEDIREQLDELDLSEEVR #oth .22..21121..1.11142445245242111111113733643523333133122.32.3 hla0487 ::L::::SA:::T::::S:ADA:RSVDEPGVDEDVNG:DDDPLAA:E:RIA::::::::: VNG0745 :::::T::TI::::EYR:AFDR---::::::::::::A:GG::DALA:T:AS:GV::::: HQ3000A ::::::::::::T::::::VD-VD:::::::::::::T:RTQ:T:L:D:::Q::::DD:Q HVO_2846 :K::::::::::T:::::TIRE:AA::::::::::::EDGRI:::::A:::S::I:DD:: Hbo2612 ::::::::::::::::::TITD:AT:::::::::::GR:RVQ:::L:KR:::M:I:QD:: NP3450A :AW::HI::::::::::Q:F::::SE:::::::::::GA:TPAG::T:T:ES::V::A:: Hut1103 ::W::H::::::T::::AA:::V:::TE::::::::EDG:::GP:PEAAIE:::::A::T rrnAC1070 :::::H:::::::::::I::S:V:TVPE::::::::EF:D:EGA:VT::::D:E:::::K Hmu1629 :KW::H:::::::::::Q::::VDG:ED::::::::R:D:A:L:E:AD::GD:E:::::: consensus RQVFDEEWLDARAEDDAEAAFPEEPRKDVLAFLRDHGMQYDEEAGKAVEMEDWQRDVLEL #oth 42..12212144435336434243.45.11111241134..31422.43322.1622114 hla0487 :D:::D:::E::G:GVE----:::::P::::::::Y:KR::P:S::::DR:P:ETT:IDA VNG0745 DE::T:T:::DI:AV:DSVQ:::T:EY:L::::::::QA:::D:E::AAF:::::EL::: HQ3000A Q::::Q::::EL::SE:AS:SIDH:QT:::G:::::ATT::D:EDE::A::S::L:I:DT HVO_2846 :E:::DA::EQVE:AER:::KLTD:::::::YV:E:::R::::T:::E:::P::K:::DM Hbo2612 K:::::::::EL::AE::::KLDD::R:::::V:E:::Y::::E:::::::S::K:::DI NP3450A D:::::::RESV:G:GDG:TV:P::ER:::G::AT::KA::::S::::GY::::QE:::: Hut1103 G:::::AFF:E::DE::G--::P::VE:LIG::AV::K:::::TDR:L::T::::EI::: rrnAC1070 :::::::::::QRD::ENVT::A::D::::G:::K::::::AD:ER:T::::::IEL::: Hmu1629 ::::T::::::QS:::EPIT:::::Q:::::::QT::::::ADGE:::::A:::S::::M consensus LRREAYYFAPQKMTKVMNEGWAAYWESLMMGDERFAGADEFITYADHQSRVLGSPGLNPY #oth ..3.11...2.13.........212..2..32.3..23...22.1..112..1.1.1... hla0487 ::E::::::G::S:::::::::T::::V:::G:G::DP:::L:::::M:::::::::::: VNG0745 :::::::::::RT::::::::::::::M:::E:A:::D:::LS:::::A:::N:::F::: HQ3000A ::::::::::::::::::::::SIV:::::S::G::D::::::::::::::::::::::: HVO_2846 ::E::::::A:::::::::::::::::::::::::::T:::::::::::::::::::::: Hbo2612 ::T:S::::::::::::::::::::::::::E:::::T:::L:::::::::::::::::: NP3450A ::K::H::::::L:::::::::::Y:::::A:::::D:::::S::::MAQ:::::::::: Hut1103 :::::H:::::::::::::::::::::M:::E:A:::T:::L::::::A:::::G::::: rrnAC1070 ::::::::::::::::::::::S:::::::TG:Q:::D::::L:S::M:K::::G::::: Hmu1629 ::::::::::::::::::::::S::::V::AG:Q::S::::VL::::M:K::::G::::: consensus KLGKELWEYVENRANRREVAERLLRVEGVTWRNFHDTVDFDEVQDRLEPDPAI----ADT #oth 1..2.1.212.1231.12.312...1411.12.12441.325.34412132322334425 hla0487 :::F:::TH::L::A::D:IDK:::I::::PE:::SRI:L:::AAA:::H:::AGAGPA: VNG0745 :::::::::::::::::A:L:H::::D::::::::::::TAD:V:T:A:PA:VAAVAP:E HQ3000A ::::::::::::S:::::::DK::::::I::Q:::AEI::EH:RAL:::::R:DAISS:: HVO_2846 :::::::::I::ST::A:::DK::::T::::::::E::::::::EH:RA::::DGVS::S Hbo2612 :::::::::I::TT::::::DK::::R:::::::::VI::::::QL:::H:::DRVRS:: NP3450A :::F:::Q:::::R:::::I::::::D:::::::D::::L:A:R:::::A:EV::::::P Hut1103 :::::::::::::T:::::L::::::::I::::LENE:::AA:RE::::PAWV::::QNV rrnAC1070 S::L:I::::::TE:::::I::::::K:I:::::D:S::YEM::G::::PAWL::::T:I Hmu1629 :::L:::T:L::SE:::::V:::::::D::::::::VI::ER:::LIA::S:V::::T:V consensus LDELDSLDPD-DPRVDAEALDRA---RDGEI-------------DVDRYPWKVLTYEGLA #oth 24514313321.211.423122.111323341111111111111.224....11121.1. hla0487 ::::AE:AA:R::::::::V:::LSA::::SPGTDSDAGPDSGP:IE:::::L::R:::: VNG0745 ::AVE::P--::AY::WQG:AA:::::ER:::::::::::::::::Q:::::LF:::::: HQ3000A VEQ:T::PG:::::I:W:M::::LS:NPETV::::::::::::::I::::::::S::::: HVO_2846 ::::SE:G::::::::H:T::::LS:G:DSL::::::::::::::L:A::::L::::::: Hbo2612 ::::AA:PG:::::::W:M::::LS:D:::V::::::::::::::::A:::::::::::: NP3450A VSH::A::::::E:::T:::SA:::::::D::::::::::::::::ES::::L::::::: Hut1103 PGW:E:I:::::::::DDT:SG:::::::D:::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC1070 PGH::D:::E::A::::DG:AA::::::::F:::::::::::::::EQ:::::::::::: Hmu1629 PAS::D:::::::::::D::A:::::::::::::::::::::::::ET:::::::EA:M: consensus ERHYSLVKPQHRGFLSRIRRSELERIARYMFDDERYDSVEEALADVDRTAGWDRMREVRE #oth 2..11.22113.1114423232.2351..1..352.22122.23..1323..1..411.. hla0487 ::::V:SR:E::NS:RNVS:ET:TEQ::::::VD::AT:D::::::::AT:::::L:::: VNG0745 H:::::A:::Y::::G:VT:D:::SVS::L::TA::A:::A:::::PV:::::::YS::: HQ3000A :::F:::Q:::::::EQ::::::QEH:::L:::T:::T::D:ID:::K:::::::::::: HVO_2846 ::::::::S:N:::::::::::::QLS:::::::V:::::D::::::K:::::::::I:: Hbo2612 :::F::::::N::::RH::::::::LS:::::N:A:ET::::I:::::AS:::::Q:I:: NP3450A :::::::::::::::KAVTKQ:::QV:::L::T::::AI:::VD:::::::::::H:::: Hut1103 Q:::::::::Q::::E:ASK:D::S::::L:::Q:::T::A::G:::Y:R:::::::I:: rrnAC1070 Q:::::::::Y:::V::VGQE::::T:::::::S:::::A:::S:::Y:R::E::::I:: Hmu1629 ::::::::::Y:::V:::SQ::::::S::::::A::E::AD::::::YSR:::::::::: consensus SHNDVTFIDAFLTQEFVDANDYFTYEYTQATGDFRVTSTDAEDVKKKLLLQFTNFGKPTI #oth .......2.1..13...3323..1..21232232.12.2224..12..112...1....1 hla0487 :::::::::::::D:::REGN::::::SR::EQH::A:V::D::R:::::R::::::::V VNG0745 :::::::V:E::::::::::E::A::FS:TR::::A:::::A:::R::::R:::L::::: HQ3000A :::::::::E:::::::SE:N::::::::T:E:Y::A:::YQ:::Q:::::::::::::: HVO_2846 :::::::L::::SE:::R::H::A:::S:SSRQ:::S:SEYR:::::::F:::::::::: Hbo2612 :::::::L:::::::::EN:H:::::F:::::E:::A:V:Y::::::::::::::::::: NP3450A :::::::::::::D:::E::::::::::HT:E:::A:::::A::::::M::::::::::: Hut1103 :::::::::::::G:::S:::::A::HS:K::::::S:V::::::R::M:E::::::::: rrnAC1070 :::::::L:E::::::::D:::::::::H:S::Y::::::H:::::::M::::::::::V Hmu1629 :::::::L:E::::::::EH::::::::HSS:N::A:::A::::::::M::::::::::: consensus AVEDGNFRNRGELLLGHQYNGVMLDIEQAKEVLERVFELWGRPVNLLTITKEFDDHDVEV #oth 2.5.2.34.11....2.3...14..442.341.2.322.....12.4..41233132231 hla0487 V:L::::::::::::::R::::A::E:S:R:T:K:::::::::A::A::RV:YS:EAIRR VNG0745 ::Y:A:HE:::::::::E:::::::R:::EAT:Q::::::::::V:H::::RVT:SERKR HQ3000A ::F:D::K:::::::::R:::IA:::Q::TA::::MHD::::::::M::::TYEE:E::: HVO_2846 ::Y::::D::::::::::::::I::MK:::G:::::YH::::::::M:::::::E:E::: Hbo2612 V:F:::YD:::::::::::::I::::A::RG::::LYD::::::::A::V::Y:E::::: NP3450A ::H:::::::N::::A:H::::Q:::::::QT::::::::::::A:K::V::LS:::I:: Hut1103 V:::A:ED:S:::::A:R:::::::::E:TD::K:::::::::::::::A:::::RE:DR rrnAC1070 V:::::YQ::N::::A::::::::::G::::::K:T:::::::::::::V:::::::::: Hmu1629 T:A:::Y:::N::::T::::::V::L:::T:T:Q:::::::::::::::D::::E::::: consensus ARRRDREPEPEEVGKRIRYDGEEVTEEDLDWEEVERIAADDIDYDTKPDEWL- #oth .21322..21314122211..43126621243342213.312..1...11..2 hla0487 :M::GT:::GK:::V:FQ:::G::::H:::P:IKA:::::E::::::::D::A VNG0745 :::N::::::::::VAL:::::S:SHAE::::T::HL::::L::::::::::: HQ3000A ::::N:::::T:T:V:L::::H:::RSE::NDLTD::R:A::::::::::::A HVO_2846 ::::G:::T:::RAI:::::::SFE:H:::P:LEA::::GEV:::::::D::: Hbo2612 ::::::::T:V:Q::::::::::FETYE::E:IT:::R:T:V::::::E:::S NP3450A :::Q::::::T:Q::L::F:::DFEI:::PD::I:D:T:T:V::::::::::: Hut1103 ::HG::::D:V:::::L::::TQ::K:TVE::T::HL::::V::::::E:::: rrnAC1070 :K::::::::::I::::::::D:::VT:V::A:::HLT:T::::N:::::::A Hmu1629 :::::Q:::::A::::L::::::::IQEV::S:::HLD::::::::::E:::S