| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 1524 | rrnAC1209 | Hut0375 | hla2351 | VNG0298 | HVO_0780 | Hbo0753 |
| 978 | rrnAC1209 | 1485 | 828 | 772 | 646 | 725 | 689 |
| 1056 | Hut0375 | 828 | 1619 | 1107 | 642 | 722 | 713 |
| 993 | hla2351 | 772 | 1107 | 1565 | 656 | 688 | 667 |
| 915 | VNG0298 | 646 | 642 | 656 | 1426 | 713 | 765 |
| 1035 | HVO_0780 | 725 | 722 | 688 | 713 | 1568 | 1145 |
| 1073 | Hbo0753 | 689 | 713 | 667 | 765 | 1145 | 1575 |
233 symbols consensus -------------AV--IDPFAVMNAVGLVAFALVGALKAIRARFDVFGVAVLGVVTALG #oth 11111112333323344311111..21..11..31.12..12132.21.1411.242.11 rrnAC1209 :::::::::::::--::------:::I:::G::F:::A:::EE:Y:::::T:V::M:::: Hut0375 :::::::VVETFLGEVL::::::::TI::::::::::A::::E::::::IL:V:L:V:F: hla2351 :::::::VSRSLV::LFG:::::::T::::::::::SS::::EE::L::IVIV:LAM:FA VNG0298 :::::::::::::--::------::::::::::T::S::::D:D:::L:::::::L:::: HVO_0780 MATLLFVSAPAAV::PE::::::::V:::L:::VA:::::AE:GL:::::S:::I::::: Hbo0753 :::::::::::::VSITL:::::::V:::L:::VA:S:::AD:GL:A::::::::I:::: consensus GGATRDVLVNRVPASLQSTGDIALALVGVALAILLIRRLDSPV--RDHPVFLVADAIGLA #oth ..1...1.1313.22.13231232212..42.2324343444111431.22113..1..1 rrnAC1209 ::T:::L:L::::N::::P:EV::S:L::TA:V:FVHF::DG-::HQ:::V:T::::::: Hut0375 :::::::::G:I:LA::NV:E:::GTL::S::LA:SFL::::-::D:::IT::::::::: hla2351 ::::::L::A:::LA:::PIE:C:G::::G:::G:NVV:S::-::ET:::T::S:::::: VNG0298 :::::::::GS:::M::::T:VGF::A::VV:VVVA::VGTE:::LA:::VD:P::V::: HVO_0780 ::T::::::D:L::::AG:W:MSV:::::::::V::HSMEGR:::::::A::TT::V::S Hbo0753 ::T::::::::P::::AT:W:MSV::::::::::::::TPEH:SV::T:A:::S::V::: consensus AFAATGALVGTQAGVPPFGVVALATINAVGGGAIADILLGRVPFILREDFYASCAVLGGL #oth ..112..1113311223111.221.2111...241.2.12.4.11.21.1..11.23.13 rrnAC1209 ::TT::::L:Q:::L:V:A::::::V::A:::::S:L::::T::::::::::::::I::: Hut0375 :::TA::I:A:E::I:S:::::V::::::::::Y:::::D:S::::F::::::P:::::: hla2351 :::TA::I:A:EV::SA:::::I::::::::::F:::::D:A::::F::::::::::::S VNG0298 ::::S:::::VG:D:S:::::V:G:TTG::::LVS:V::Q::::V:T::L::T::IA:ST HVO_0780 ::::::::::VD:::TS::::I::::T:::::S:::::I::::VV::D::::TP::V::: Hbo0753 ::::::::::A:::LT:Y:I:V:::VT:::::SL::L:I::I:VV:::::::TP:L:::I consensus AFWAATAVGAPAGVAAAACAGVTLATRLLAIRYGWHLPTVQALERARD----- #oth 22112423.3323311141.421232.3212322.4..222543343331111 rrnAC1209 ::::LAQI:VSVS::S:G::LAV:LA:G:G:GR::S::::::W::RDAQ:::: Hut0375 S:::V:T::WTVAP:::M::T::VG:::V:VSR::::::A:T:GL:::VDGSE hla2351 :Y:VVGTL::T::T::::::V::VG:::A:VT:::N:::A:N::LQ:K::::: VNG0298 VL:V:::S:LG:TI::::G::::::V::::::FE:A::::RLNAP:--::::: HVO_0780 ::L::R:::::T::PSGL::A:VFSV:V::L::D:R::R:--------::::: Hbo0753 :::V:D:::::T::P:GV:::LVF:::M::L::E::::EIRVEG:TG:S::::