|
Pairwise sequence scores | |||||
---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2453 | hla0169 | VNG2086 | HVO_0447 | Hbo1060 |
1467 | hla0169 | 2730 | 1082 | 1222 | 1212 |
1536 | VNG2086 | 1082 | 2380 | 1317 | 1333 |
2128 | HVO_0447 | 1222 | 1317 | 2576 | 2041 |
2105 | Hbo1060 | 1212 | 1333 | 2041 | 2575 |
394 symbols consensus ------MASRRNFLKTAGAAGVAGLTALSGCTGGGN--E--TTT---G-------T--ST #oth 111111222..3.21.1.11.12.222.1..21223221221112221222222212222 hla0169 MSDNRWS:N::T:V::::::::V:---:A::SD::T::-::---:::-:::::::-:::G VNG2086 ::::::-MD::::::::::::TI:ISG::::L:---::-::---:::-:::::::-::VL HVO_0447 :::::::::::E:IR:::IT::::::::::::::DDSS:AT:::TES:ASSETEA:TT:: Hbo1060 :::::::P:::K::::T::T:::::::::::::D::TT:QS:::NTD:STATETT:EGT: consensus TGGSSAASIMFALTPAESDVDVEAQYQPLFNYIESEVGVTIESTVAADYAAVLQALR--- #oth 22221332121111...1111123..212.2.1...2122122211.112112.113111 hla0169 DS:N::TEVTWVMN:::EEI:IQV::::M:E:L:::ADIE:IEQPT:S:SGTA:E::RAS VNG2086 G::GED:DVR:V::::::::N:KE::AGV:D:L:::T:AS::PK::::HQ::::::E::: HVO_0447 :TE::PE:::::::::::::::::::::::::::::::::V:::::::::::::::D::: Hbo1060 ::S::KD::::::::::::::::K::K:::::::::::::VD::::::::::M::MK::: consensus SGQADIADASP-AIAIQGDNEDVTDVIGIRVAYGASRYFSLITTTPDSDIEELSDLEGET #oth 211111..11.122.22111221.312.1.1....11...11..11..2.12.2..2112 hla0169 E:DRVF::T::G:V:QIP:QL:::---:M::::::EK::::::::A:::::::A:::::V VNG2086 ND::::::::::TL:VV:::AS::::V:::::::::::::T:::Q:::P:DS::::AD:: HVO_0447 :::::::::A::::::::G::GI:E:::::I::::::::::::::::::::::T:::::: Hbo1060 ::::::::::::S:::::G:::::K::::::::::::::::M::::::G::K::::K:KN consensus VAFAARLSTSGSLFPLYMLSNAGLDTGGAPDGNPEDFEAKFS-DHSTAREQLINRDDVVA #oth 1111111.1..1....2..13..1.2.2..2.3131.2222.1..1..1.1.121.222. hla0169 F:S::PT:V::T:::::::::::I:I:S::S:S:::::LRT::::::::::::QD:RIA: VNG2086 :V:G::::::::::::Q::AD::::V:D::E:EVT::TG:W:N::N::I:::LE::EYM: HVO_0447 ::::D:::::::::::S:::T:::::::::::::V::::Q::::::::::T::::::::: Hbo1060 ::::D:::::::::::::::K:::::::::::K:KG:S::::::::::::T::::::::: consensus AGTGAFSTAPHVPQDQFPE---QFLDISAENDGALGTEDPELQLLAASDPIPRAPILGRA #oth ......1111.1.22.11111111211.112.111.221...1..12........11212 hla0169 :::::::::S::::E::D:MSQE:V:::::Y:::-:ED::::::::V:::::::::VSN: VNG2086 ::::::VSL:::::S:L::::::VMN::SDA:T:-::::::::::::::::::::L:A:R HVO_0447 :::::::::::::E::::::::::::M::::::D:::AS::::::SC::::::::::::T Hbo1060 :::::::::S:I:K::::K::::::::::::::D::S:S:::K::::::::::::::::: consensus AMDQSLYDDIRTALLDATEE---------------------DLINSDLSDDQQ------- #oth 31121121.13211111222111111111111111111111.122221211121111111 hla0169 :WEE::K::::QLMI::PQ:AFEHDSQADIAEALNIDPEIL:MDE:E::E::REDLDLVE VNG2086 SWEG:VRS:VQ::::::::S:::::::::::::::::::::::KG:NA::E--::::::: HVO_0447 D:::G:::::EE:::NV::D:::::::::::::::::::::::::E::E::::::::::: Hbo1060 E::::::S::K:::::VSK::::::::::::::::::::::::::D::K::::::::::: consensus ---LWFTGVDEASVDDYAPVQNVLDELGLTLGQ- #oth 111...1..221121..3.1221221.1122121 hla0169 AHA:::S::V:::AE::D::AQLGQ::::EWNEL VNG2086 :::::::::A::TI:::E:IR::KNT:N:KF:N: HVO_0447 ::::::::::QG:::::::::E::::::V::::: Hbo1060 ::::::::::KG:::::Q::::::::::V:::::