| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3799 | HVO_1213 | Hbo0344 | hla0723 | Hut1651 | rrnAC2191 | Hmu0420 | VNG0954 | NP2154A |
| 1482 | HVO_1213 | 3668 | 1594 | 926 | 1019 | 1033 | 1079 | 874 | 977 |
| 1528 | Hbo0344 | 1594 | 3424 | 951 | 1056 | 1021 | 978 | 1008 | 931 |
| 2056 | hla0723 | 926 | 951 | 4913 | 1598 | 1605 | 1552 | 1220 | 1289 |
| 2383 | Hut1651 | 1019 | 1056 | 1598 | 4332 | 2222 | 2229 | 1355 | 1320 |
| 2735 | rrnAC2191 | 1033 | 1021 | 1605 | 2222 | 4346 | 2898 | 1347 | 1474 |
| 2705 | Hmu0420 | 1079 | 978 | 1552 | 2229 | 2898 | 4287 | 1365 | 1473 |
| 1908 | VNG0954 | 874 | 1008 | 1220 | 1355 | 1347 | 1365 | 3914 | 1479 |
| 2020 | NP2154A | 977 | 931 | 1289 | 1320 | 1474 | 1473 | 1479 | 4281 |
752 symbols consensus -----L-----------P-------------------------LLT-GLVGMSI--MFDS #oth 123231311111111111334233331111112233223242223242212323343533 HVO_1213 :::::-:::::::::::-:::::::::::::::::::::::::---:-------:VLAA: Hbo0344 :::::-:::::::::::-:::::::::::::::::::::::::---:-------::--MG hla0723 :MGLE:::::::::::::VWGAPTAAWI:::::::::::::::VA:L::::A:V::-L:R Hut1651 MSTLS:LQSGTVVEGVD:TLLAATGDWIVESVGSLSTEPLAVGV::V:V:::::RSV::: rrnAC2191 MSSLA:V:::::::::::LAPAVSPE::::::LAGLAPALFV::::G:::::::KN:::: Hmu0420 MSSIA:F:::::::::::TLQVAIPE::::::GSIFAPALVV::::G:::::::KN:::: VNG0954 :::::-:::::::::::-::::::::::::::::::::MTIID:TPTAV:FVQFGALVVG NP2154A :::::-:::::::::::-:::::::::::::::::::::::::---:-------:::I:N consensus ILSDDD-----GDDDGDEDADGGGLMADDGGGG----DDLGGDDGDLGG-G------DDD #oth 3231431223244323455543344452224.22233123123332222422322231.2 HVO_1213 MMEWQN:DEDTA:TGDET:TEEQHMSS:::L:FEEGI:::SDEF::F:-:-::::::::L Hbo0344 MMDWI:::::::E:EETRSDGE:TGL:T::L:FDEDL::F:D:F::FE-:-::::::::: hla0723 F:D::-::::::S::D:SGGM:::---::PF::::::GGM::GG:GM::G:GGGMGGG:: Hut1651 ::::E:::::::GP:V::-G:DD:::PEE--::::::::::----:::-::GFG:DGG:: rrnAC2191 :::::E:SENAS::G:GGM:::::::G:::::::::::::::GGD::::L:GLD:DDG:: Hmu0420 :::::EESDDA:G:::::L::::::::::-::D:::::EF:----::::M:::::::G:: VNG0954 MA:WL::::::--:E:S:---------:S::::::::GGG::::S::DMDEDFDDDF::E NP2154A L:G::::DEPADEAG::D:M:::LFDE:E:A::DDLMGGG::::DLM::D-::::::::L consensus MGGFD-----DD--DFGDMDDG-G--SDTDELEHRLDELENEVSSLSSTVNTVRSENEQI #oth 222121111111112112221242226332.123.231..1..2231.321..13..12. HVO_1213 DD::::::::::::E::GFG:DNS::EELA:::D:VG:::::::AI::GM::::E::K:: Hbo0344 :E::::::::::GG:::GGGG:DVDPNTIA:::D:VSD::::::AT::S:::::E::K:: hla0723 FDD::GMDEW::::::D:GGG::::::::::::K:::D::::::::::::S:::::::E: Hut1651 F:D:E::::::::::::E::G:::::A:::::Q:::::::T::G::::::::::N::::: rrnAC2191 ::::G:::::::::E::::E:AS:::P::::::::::::::::G::::::::::T:::S: Hmu0420 :D::G:::::G:::E::::::A::::Q::::::::::::::::G::::::::::T::::: VNG0954 F:S::::::::M:::G:GG:GAG:AD:SVN:::N:IED::T:::NVA:KA:::::::::: NP2154A :::G:::::::M::G:::::::::::TT:A:MDN:I:::::::A:::::::::K:::::: consensus SESVEDVEENVRKLLDIYEMVTRGVNPFVDDAD--RGMGGGG--GGGGSFGLFDDDEEED #oth 11211131121.1..11.......1...1.142135231.52213112211..2323224 HVO_1213 G:T::ELDDTI:::::::::::::I:::::::-:::E:::L-::D:::A::::EAEA:DE Hbo0344 G:T::ELDDT::::::::::::::I:::::::-:::E:::L-::E:::::::::AE:::E hla0723 :AA:D:I::D::N:::::::::::I::::::S-::S:FD:VDD::SE::::::::::::N Hut1651 ::T:D:::::::::::::::::::::::A::I::AG:L::--::P:EE::::::NGDDQS rrnAC2191 :::::ET:::::::::::::::::::::A::V:::G::::M:::E:::::::::::GSD: Hmu0420 :::::E::::::::::::::::::::::A::I:::A::::::GM::::G:::::::DD:T VNG0954 :::::::::::::::E:::::::::::::::V::PNAA::P::::::D::::::E:::DS NP2154A :::L::::::I::::EV:::::::::::::ENEMGDAF:::::::::::MS::G:::::: consensus E--EDLDEDVANADAEGFFDEDLGDDDEEDDD-----V-D-F-DDG----D--GGFE-DD #oth 223422.311.3.1.12..11.35112532644342333242412211131222211122 HVO_1213 :::-Y::PE:::::::S:::D:F:EL:A:EGAK::::-:-:-:---::::-::----:EA Hbo0344 :::-H::P:::S::::S:::::F:ELE::SE-:::::-:-:-:---::::-::----:EA hla0723 :ADD:::::::::::D::::D::L:::L:::-:::::-:-:-:---::::-::----:-- Hut1651 ::EG:::::I:::::::::::::VE:::LEA:ADVGD:LGTGE::::::G:D:::::::: rrnAC2191 T:E::I:D:::::::::::::::T::TGG:MSMDDGG:D:M:P::::::G:DM::::::: Hmu0420 :::::I:::I:::::::::::::VE::GD:LGGGGDS:D:V:A::::::S:D:::::::: VNG0954 DETG:::T:::E:E:DE::ED:AF:::F::::GEMDDEFGD:E::DEEMD:EF:D::::: NP2154A :::A:V:D:I:D:::DE:::::ID:::D::F::::::DF:D:D:ED::::-::E:::E:: consensus DGAFEDEFDDFDDEDDD-------ADDDFGDDEA--MDDDDDGD--GDGGKSFAELKDEY #oth 3443211122412442345221215123333335436334315211241.3..41..31. HVO_1213 EL:A:::LAEAER:SPADVL::::D:E:DEHG::GEA:ET::AG:::A::A::DD::EQ: Hbo0344 EL:A:::LAENER::P-::::::::EEIL::E:P::VVE::EEE::AS::S::DD::S:: hla0723 ----D:::AEL:E:P::EH:::::T::GDSA:A:SETAAA::::DMN:D::::S:::E:: Hut1651 ---:::D::MD::FG:-::::::::E:::DM::G::G:G:A:SG:::E:::::::::::: rrnAC2191 G:S:DE:::::::TE::MS:::::M::GMSM:DGES::E:S:-::::::::::::::::: Hmu0420 G:S:::D:::::EGG::LGDFDE:E:::MSM:--:::::GG::::::E:::::Q:::::: VNG0954 :EEVD:::G::E:D:EE:::::::M::E:::F:DDDSE:A:::E:::G::T::E:::E:: NP2154A :DG:G:D::::::D:::DDDDDDFG:GG::::DFDDD::F:ED::::G:::::E:::A:: consensus ESGDADWAEEDEAEGDADDDD------------DDDDDLADEDDDLEEEDD-DGE----L #oth 121112.11224434156534422111111111433353333223256322341332221 HVO_1213 :E::G-:DD::D:AA:-----:::::::::::::AET::D:AAV:::D::::---::DA: Hbo0344 :EEEG-:D::::E:DEEV::SP:::::::::::L:T::::V::::IPTTEELV::E:::- hla0723 DA:E::::D::G::T:::AA-::::::::::::A:E:PFD:GG:SF--:::LG::::::- Hut1651 :A:::E:::G:AEDP:ESIEETTDDLAADDDSL:::EA:V:::::FAM::::G::AGDG: rrnAC2191 :::::E:::GE:P::ES::::LLAD::::::::::::L::::G:::LG:::S::DA:GG: Hmu0420 D::::E:::::SPG::MAL:ED::::::::::::G::EM:L:::E:SSGIEE::DDLDG: VNG0954 :::::::::GE:I::E:GIEA::::::::::::E:KP:IGFD:S::::D:A:---::::- NP2154A :::::::D:DG:GGDEDEG::L:::::::::::GM:EGFD:A::A:::T::SL:A::::- consensus -DDDLFDDVIEDD--GDDEEAD--ADATEDEPEPEEDDEEDD-----P---GLEPEPEAD #oth 313132244431311231543124513425443445324332132233324452413333 HVO_1213 D:A:PL:SETA::AEE:::PG:EVS:ES:TD:A::IE:G:Q::ADGDVRKTLD:L:A:YA Hbo0344 :------------::DAES:EEEEEETL:E:L:AG:P:T::::::::-::VE:TD::V:T hla0723 :-P:P:::GP---:::::GP::DGV:SFDEGMGAFD:GPV::::::G:VTN:H:::S:P: Hut1651 A::::::T::::E::::E:S::EAV::::SATSVV:::T:TEETEPDQETITP:E:SVTE rrnAC2191 E::::::E::::::::I:-::E::TE:M:A:::::P:P:PEP::EPE::::VA:::::PE Hmu0420 A::::::::::::::DE:LT:E:::::S:P:::::PEP:PEPELEPE::::EP:::::PE VNG0954 :-::A:E:DLD:A:::::F::E::::::A:DD:EMAA:SG:::::::-:::::VS::D:: NP2154A :------------::D::LNS:::LEE:D:TD:FGM::GV:::::::-::::FVS---:: consensus PEADTTDEPEPAGEPAAAA--ESGDASE---------DGGK--PYLAELPGGYVADLIVL #oth 224553444333353454334345445443433223244131111.322.5312212232 HVO_1213 TA:G:K:GLSDD::DG:V:EP::SASV::::::::::ES:A::-:::T::SN::SEVL:: Hbo0344 T:T:D:GSF:F:ETT:DQTSQQTDE::DV::::::::----::-:::S::AS:::ESVA: hla0723 ::::RSRG:Q:G:D::E:-::-:::GF:YVREGDLSGTR:::::::T::::D::G::L:M Hut1651 TAQTEE:AT:::ANAE:PSAK:EA:G:GATEGASAES:D:::::::TS::D:FL:::::V rrnAC2191 ::PAAEP::::EP::TDT:ATG::::ATADDGSDAD::D::::::::TM:E:FA::::IV Hmu0420 ::PT::A::::EP::TTT:EP:PEPEL:QTPNASAD::::::::::S:::::FAS::::V VNG0954 :GGRMSAPTG:GAA:GL:-::-------:::::::::V::EDG:H:::P:T::L::VVC: NP2154A EA:S:::SE:SD:Q:PI:-::-------:::::::::-::::::::ET::S:::::VV:M consensus EWLEFLVEEAGARGAARAIDYYERIDWIDEAVADQLNAFLRGFADSDED------SDELT #oth 1.212.143424541211131.2312.2234123315331523454465553321664.3 HVO_1213 ::A:H::TVG::L::S::LRQ:REQ:::SR::ESE:::HVGQI:P:V::AD::::DH::R Hbo0344 ::TR:::SVG::I:::::LRQ:REQE::SRT:EK:M::HV:NA:A:TTAEE::::PQD:R hla0723 :::::::S:SDVTD:V:::N:::::E:VGPEA:AR:RD::S::GTI:RNLVDRPGT:R:V Hut1651 :::::::::V:I:AT:E:::::::::::::S:::::Q:Y:K::EEGG:-:::::::ES:: rrnAC2191 :::::::QHS:Y:ET::::::::T::::::S:::::KEY::::DGVNDT::::::G:G:S Hmu0420 ::::Y:L:Q:SY:E::::::::::::::::::::D:HEV::::EE:GG-::::::KGG:: VNG0954 ::::::LT:F:PKNTV:T:N:::::G::G:P:R:::FD::E:LT:::YLYREEFG:T::: NP2154A D::::::D:::VD::::TLS::GA:::L:AEA::D:QT::Q::G:DVA:DPAP::RSS:: consensus IDHHTESLRYISQLAGDSG-EAVALDE-------LV----------------RR-GGGS- #oth 321.43..5.132123434135423431111321.4111111111111111143322241 HVO_1213 ::D:QT::A:VCR::E:VP:RGQLYE::::::::::::::::::::::::::AY:::RF: Hbo0344 VE::K:::T:V:R::::VA:::RL:E:::::::::S::::::::::::::::H:::::H: hla0723 RE:::R::::VT::N:T:::HLLL::R::::WDD:AGGSLVGGGPPRIGSGG::GR::HG Hut1651 :::::K::::V:::N:GGA::SI::QQ::::::::P:::::::::::::::::QT:::P: rrnAC2191 ::::::::H:::::DS:::AD::::SK:::::::::::::::::::::::::--:::::: Hmu0420 :::::R::H:::::DE:::AD::::SK::::::::::::::::::::::::::-:::::: VNG0954 M:D:L:::E::EE::SEDI::R:IV:R::::CED:H:::::::::::::::::-:----: NP2154A VA::NT::Q:::RI:NPDM::M::FN:RNDGRDD:A::::::::::::::::T:N:RR:G consensus ----------------DGIQR--------------------------------------- #oth 22111211221222212.321222221222212212222222222222222222222222 HVO_1213 :::::::::::::::::::RC::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0344 ::::::::::::::::R:LR:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla0723 GRGRREERSPREDRSS::RD:HASENGHGGDAENRNGHAERRNGHAERRDDHADRHGSEG Hut1651 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC2191 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0420 ::::::::::::::::::L::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG0954 ::::::::::::::::N::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP2154A RQGRRREREERHTVES::GR:SGGPLGDASVADRRPPRLRSPRRRDAGGGEPDSGFNGGH consensus -------------------------------- #oth 22211111111111111111111111111111 HVO_1213 :::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0344 :::::::::::::::::::::::::::::::: hla0723 RERNDGSPRPMNDPNPRSDRADPADGGWGDGR Hut1651 :::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC2191 :::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0420 :::::::::::::::::::::::::::::::: VNG0954 :::::::::::::::::::::::::::::::: NP2154A NRN:::::::::::::::::::::::::::::