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[N] (FlaF) COG3353 Putative archaeal flagellar protein F
8 genomes BUD0835 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0953

rrnAC2190

HVO_1214

Hbo0343

Hmu0421

Hut1652

hla0722

NP2094A

-

Pairwise sequence scores
Consensus score1056 NP2094A Hbo0343 Hut1652 rrnAC2190 Hmu0421 hla0722 VNG0953 HVO_1214
523NP2094A 1090 373 343 373 400 311 394 405
579Hbo0343 373 1092 423 418 439 353 382 489
571Hut1652 343 423 1102 473 429 284 448 377
692rrnAC2190 373 418 473 1060 644 418 508 452
678Hmu0421 400 439 429 644 1082 439 490 479
610hla0722 311 353 284 418 439 1125 425 455
666VNG0953 394 382 448 508 490 425 1044 515
674HVO_1214 405 489 377 452 479 455 515 1037

164 symbols
consensus       MGFSVSGSAAIIFAGAFIAFGTFYSAASNGFERVNDAQDARNDRLLERQNTDIAVTNATY
#oth            1.11..1.1112231422231222233423423142.344561341324..325233212
NP2094A         :::::::::V:V:I:LVV:A:IAVPPLMGSVGNLAS::GTQI:QGT::L:::VEIAA:::
Hbo0343         V::G::::T::::L:VL::T::L:TTV:DTT:ML:::E:SNSEH::::R::G:N::SV::
Hut1652         :::::::::::LLVAF:V:::::::::::SM:T::::RG:AQ:D::AQ:::A:TL:DVSV
rrnAC2190       ::::::::::V::VA:::G::M:::::A:::::::::REDQR::::DQ:::::SLVS::W
Hmu0421         :::::::::::V:::M:::::M:HT:TT::::::SE::ED:T::T:AQ:::A:D::S::W
hla0722         ::V:::A:T:::V::L:F::T:::PV:A:::D::S:::HGI:E:A:::::::F::S::::
VNG0953         :::::::::::L:IA::VSV:IL::::F::::::Q::NN:::::V:TAK::VVE:A:T::
HVO_1214        :::G::::T::::L:VL::T::L:T:T::AS:N:LE::::DAE:A:::T:::::::::::

consensus       DDN-NGT----LTVNVTNTGSETLSVSDTDLLVDNEYQ--D-SGADTTVDGDSDTDLWLP
#oth            34423441112232424.3.242.214322211113222135444532.2.233112.24
NP2094A         ::D:AEE:::::DIELE:::TTS:::A:::::::GAM:T::ADNLA:::E::A:AE::::
Hbo0343         SN::S::::YPMDIR:K:::TL:::AN::SV::N::::::QP::STR::::T:G::I:A:
Hut1652         AH:VS:DELYYVNAT:K:::ANG:::A:::FM::G:L:T:-::FL:RA:::::S::V:AT
rrnAC2190       NSSG:DN:::::V:T:D:::::::::EA:::::::D:R::-:T:YG::::::GS::I:AS
Hmu0421         NTT:SR::::::::A:N:::::S:A:::V:::A::S::::-:::Y::S:G::D:::::::
hla0722         ::T:T:N::::::::A::D::IG:VAG:AT:::::::VDVGGAN:T::::::G::E:::G
VNG0953         :SV::D:::::V:::A::N::T:::::Q::V:::G::VT::SAYVSSS:::N:Q::::::
HVO_1214        :T:::TS::::::::L::V::::::::E:T:::::A:V:::VPS:NAS::::AG::::YA

consensus       GETLTITVTAD-------SQPDRVKVVTENGV--AATEVVS---
#oth            3131343234521111115514.112.313.1112324524432
NP2094A         A::::M::G:T:::::::TE:::::::::::IER:TNDITDGET
Hbo0343         N:::L:EL:V::::::::NE:K:::I::::::::TDSNSTLEEV
Hut1652         :QR::ANM:VP:::::::T::::L::::GP:::::::::GLSG:
rrnAC2190       Q:R:E::::SLS:::::::::G:::::A:::I:::E:M::::::
Hmu0421         Q:Q:::::::LD::::::DD:G:::::SGT:::::D:ATTTEVV
hla0722         ::::::E:DKNDLSTDVVAGET::VL:V:S::::RD:AE::A::
VNG0953         :::YSV::PTG::::::::A:T::::::GT::::T:::::-:::
HVO_1214        ::N:SFV:D:::::::::PT:E::::::GS::::::::A:::::