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Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2499 | VNG1365 | hla2613 | HQ1505A | HVO_1107 | Hbo0611 | NP3808A | Hut0164 | rrnAC0039 | Hmu1073 |
1492 | VNG1365 | 2295 | 1156 | 1216 | 1232 | 1282 | 1317 | 1327 | 1278 | 1241 |
1639 | hla2613 | 1156 | 2497 | 1418 | 1598 | 1403 | 1416 | 1239 | 1386 | 1361 |
1704 | HQ1505A | 1216 | 1418 | 2500 | 1552 | 1659 | 1407 | 1329 | 1380 | 1334 |
1814 | HVO_1107 | 1232 | 1598 | 1552 | 2507 | 1650 | 1494 | 1255 | 1465 | 1384 |
1797 | Hbo0611 | 1282 | 1403 | 1659 | 1650 | 2436 | 1448 | 1291 | 1411 | 1381 |
1867 | NP3808A | 1317 | 1416 | 1407 | 1494 | 1448 | 2709 | 1387 | 1596 | 1490 |
1580 | Hut0164 | 1327 | 1239 | 1329 | 1255 | 1291 | 1387 | 2587 | 1596 | 1491 |
1886 | rrnAC0039 | 1278 | 1386 | 1380 | 1465 | 1411 | 1596 | 1596 | 2518 | 1695 |
1773 | Hmu1073 | 1241 | 1361 | 1334 | 1384 | 1381 | 1490 | 1491 | 1695 | 2564 |
380 symbols consensus --MRRRVAAGIALTVAIFLLVQLGALALVEPFYEAGYQAVEDPSDPTNSLLYIGAILVAT #oth 13455144433253251.221.1.1....42.7331213111.31.2.123.1311111. VNG1365 MNDST::::VL:GV::L:VV::V:::::::::QS::L:ST:N:QN:L::VV:VAFL:::: hla2613 :::FP:EYR:V:FV:GL::V:::::::::PE:A:S:::::DN:DN::::::::A::IAM: HQ1505A :::H::::F::GF:AVL:F:I::::::::PT:::Q:::T::::TN::::::::::::::: HVO_1107 :::S::AYR:V::AAL:::V::V::::::PT:F:Q:::T:::::::::::::::::IAM: Hbo0611 ::::N:::F::G::TL:::::::::::::T:::DG:F:T:::::::::::V::::::::: NP3808A ::-MK:AF:AV:A::CL:::::::S:::::::MS::F::::::::::::::::I:::::: Hut0164 MARY:GLTLS:SVI:S:::F:::::::::D::KT::L::::::QN:V::::::A::::M: rrnAC0039 MER:W:ILG:CG:IAG:::F:::::::::Q::ES::::::::::::::::M::::::::: Hmu1073 MEE:K:::L:LGIV:::::F::::::::::::-DQV:DP::N:Q::::TIY:VV:::::: consensus GVMLAAFKYDVDWLIRGLIVFTSAWLSWYVFSVLVPPV-------G-NLAAVALALALGV #oth 131.1121223133222212432252131..32431423443111132351343132223 VNG1365 :GI:LVI:::KQ:IL::VVLV::GLVAS:::A:AI:A:VVA:::::V:::VWGP::::VG hla2613 :L:::::R::L:QG::L:::GV::::::::::AV:SQ-:::::::-:-:::AVP:I:V:: HQ1505A A::::::::ELQ::VK:F:TLAAGS:A::::::FFS:-:::::::-:-:L:AIP:VG:A: HVO_1107 AF::::::::L:Q:::LV:::::GL:A::::AA:::SA:::::::-:-:V::G:SA:VAL Hbo0611 A:::::::::F::AV:A:V:L::GM:::::::IIL:F-:::::::-:-:P:::A:VLVAG NP3808A ::::::M:FG::R:LQ::VL:AAVFI:F:::T:V::::VAVA::::L::V:::::::::: Hut0164 :::::::::E:Q:A::::::A:G:YIALL:::I:L:::VTLPVGD:LHGL:WVG:IG::: rrnAC0039 A:::L::R::::Q::::::::SA::::L:::Q::::::FTYA::::L:VG::L:::G::T Hmu1073 ::::::::LG::E:::L:V:GSG::::L:::::::::APPVL::::I:AI:L:G:V:I:: consensus ALLVYPEWYVIDAAGALMGAGAAGLFGISFGLLPALVLLTVLAVYDAISVYGTEHMLTLA #oth 2.32....11..21.22..111.1....1..11..21..33..........1.1...31. VNG1365 ::YA::::W:::::::I::M:::A:::::::V:::I::::A::::::::::::::::::: hla2613 ::::::::::::T::V::::::::::::::::::::L::AF::::::::::::::::S:: HQ1505A L:II:::::I:::::V:::::::::::::::::::::::SI::::::::::::::::D:: HVO_1107 :::::::::::::::V:::::::A:::::::::::I:::S:::::::::::K:K:::D:: Hbo0611 ::V::::::::::T:II::::::A:::::::::::V::::A::::::::::::::::D:: NP3808A G::::::::::::::IV::::::::::::::::::::::V:::::::::::::::::A:: Hut0164 ::YA:::::::::T::V:::::::::::T::VF::::::S::::::::::::::::::I: rrnAC0039 ::::::::::::S:::V:::A::::::::::V:::::::::::::::::::::::::::: Hmu1073 G:Y:::::::::T:::::::AG:::::::::V::::L::::::::::::::::::::::: consensus SGVMDLRIPVVLVIPTTLSYSLLDDDFP-ATAD----DDGDAANDDGD------------ #oth 3.1.1.32.111.2.2112..222345475544345452453353533311111111111 VNG1365 ::::E::L:I:::V::::A::FVE:---:----::::-----------:::::::::::: hla2613 E:::::N::::::::LS::::::GEQSESEGD:::::T:::S:I::::P::::::::::: HQ1505A A:::::NL::I:::::::::::RE:VS:V::D:NTNVSVS:NETHTHAN::::::::::: HVO_1107 E::::::::::::::::::::::::::ARDANE:::VG::EN:T:G:EP::::::::::: Hbo0611 E:::::H::::::::::::::::::::-:----::::---SS:::VH::::::::::::: NP3808A ::A::::L::IF:V:L:::::F::A:N:ESLE:DTPES:AE:EP:E::DVSTATGDAEPV Hut0164 ::::::KV:::::A:MSVG::FRE:TAGLDEESDNEQA:PT:DDATTEP::::::::::: rrnAC0039 :::::::V:::::::M:::::Y::ATT:NP::EDETS::SA:::::TE:::::::::::: Hmu1073 N:::::KV:::::::L:::::F::S:T:D:::QTSAE:::S::D::TA:::::::::::: consensus --AAEDADTPSAEAADADDPAD-------EADPLE-RDAFFIGLGDAVIPTVLVASAAFF #oth 245553224464636224234432111115423442.2.2......111.1111..1.2. VNG1365 :::::T::EAE:GERE:AA::::::::::------::P:Y::::::::M:SIM::::::: hla2613 DANSD:L:N:DES:DEGA:VSE:::::::PT:IED:::::::::::::::::::::::T: HQ1505A EL:EH::E:::SIDETST:DSHI::::::------:::::::::::::M::::::::::: HVO_1107 :AGTV::::ETETTN::N:D::::::::::S::AD:::::::::::::M:::M:::G::: Hbo0611 ::-DP::EA:PSPES:GG::T::::::::DS:EEGV::::::::::::M:::MI:::::: NP3808A DTM::::::DADSD:::::::AAEAAPDEH:::FA::::::::::::::::I:::::::: Hut0164 EDTDVT:ESG:::::EG:----:::::::S:::::D:E:L:::::::I:::::::::::: rrnAC0039 ::----:T:GTG::DES::V--:::::::H:::::::::L:::::::I::SI:::::::: Hmu1073 :::TPVT:SDGGV:V:::::VEGVA:::::EG:::::::L::::::V:::::::::::H: consensus -A-SDAPSLG-PGI-AITLPALTAMVGTFAGLLVLMWMVLKGRAHAGLPLLNGGAIGGYL #oth 13447235134333233411212.12.133.143.124.41..1..........1.1..1 VNG1365 :-:L:T:PV-:--VAG:E:AP::::A::LV::::::R::FA:::::::::::::::A::: hla2613 :-::P:AA:DM:L::G:N::::L::::SL:::::::SW:I:::P:::::::::::::::: HQ1505A LPGELT::::IF::P:M::::::::I:::I::F::::L:V:::::::::::::::::::: HVO_1107 :-::E:::::FGALP:LN::::L::::::::FSG:::A:M:::::::::::::::::::: Hbo0611 LPDAA:::::V::LPIL:::V:::::::::::FA:L:L::::::::::::::::T::::: NP3808A :RPGGVEL:SV:::::L:V:::G:::::I::::A:::F:M::::::::::::::::A::: Hut0164 ::DASV:TVDIGAF:SVAV::A::V::::L::A::LR:::A:::::::::::::::A::: rrnAC0039 ::S::VL:V-:--F:GVP:::::::::SYV::TI:L::::::::::::::::::T:A::I Hmu1073 ::GETT:EV-:--L:S:P:::::::::S:V::A:::R:::::::::::::::::T::::: consensus VGALAAGIPLVDALGLAPYL #oth 2.1222.3222412.12322 VNG1365 :::V:::::IL::::V:A:: hla2613 I:SVV::V::IE:V:::GF: HQ1505A I:::LS:V::IR::::---- HVO_1107 ::SVV::V:::S:::::::: Hbo0611 I::VLS:::VLT:I::---- NP3808A L::A:V:::V:E:::V:::: Hut0164 :::::S:MT::ET:::G::: rrnAC0039 ::::::::S:::::::G::: Hmu1073 ::::LS:LT:I::::::::F