|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2437 | Hut1381 | VNG0593 | hla1827 | NP1580A | HQ1525A | HVO_1412 | Hbo0134 | rrnAC1489 | Hmu1740 |
1842 | Hut1381 | 2436 | 1727 | 1621 | 1805 | 1600 | 1729 | 1694 | 1729 | 1796 |
1925 | VNG0593 | 1727 | 2543 | 1703 | 1818 | 1633 | 1780 | 1726 | 1747 | 1827 |
1966 | hla1827 | 1621 | 1703 | 2507 | 1704 | 1759 | 1802 | 1848 | 1718 | 1720 |
2065 | NP1580A | 1805 | 1818 | 1704 | 2443 | 1778 | 1883 | 1911 | 1906 | 1909 |
1937 | HQ1525A | 1600 | 1633 | 1759 | 1778 | 2437 | 1847 | 1888 | 1733 | 1696 |
2179 | HVO_1412 | 1729 | 1780 | 1802 | 1883 | 1847 | 2461 | 2140 | 2032 | 1978 |
2151 | Hbo0134 | 1694 | 1726 | 1848 | 1911 | 1888 | 2140 | 2444 | 1951 | 1917 |
2079 | rrnAC1489 | 1729 | 1747 | 1718 | 1906 | 1733 | 2032 | 1951 | 2456 | 2075 |
2114 | Hmu1740 | 1796 | 1827 | 1720 | 1909 | 1696 | 1978 | 1917 | 2075 | 2441 |
340 symbols consensus ---------MKATAKAHPIQGLVKYHGMRDEELRLPYHDSISVCTAPSHTKTTVEFDPDA #oth 1111111221....2......11....1.1322.3.......1....1212..1113122 Hut1381 ::::::::::::::T::::::::::::I::P:::T:::::::L:::::NST:::A:E:ER VNG0593 MRATPPHRR:::::R::::::::::::::::S::M:::::::::::::N:T::::::::R hla1827 :::::::MTE::::R:::::::::::::::P:::::::::::L::::TA:T::::WQ::: NP1580A :::::::::::::::::::::::::::::N:::::::::::::::::::S:::AA:E:ER HQ1525A ::::::::::::::R:::::::I:::::::SDK:Y:::::::::::::A:T:::::QS:: HVO_1412 ::::::::::::::::::::::::::::::T:R:M:::::::::::::::Q:::::R::: Hbo0134 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q::: rrnAC1489 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::AA:::NR Hmu1740 :::::::::::::::::::::I:::::::::::::::::::::::::::S:::AA:::EL consensus DEDVYVIDGEEVDGRGAERIDAVVDHVRELAGIDHRVRLESENSFPSNIGFGSSSSGFAA #oth 33.4.11121512.11.1..33..13..22113133..22.3.3..1.1.1...1..... Hut1381 P::E::::::HI::::::::RT:::N:::R:DL:E:::VA:::N::::V:::::A::::: VNG0593 :A:Q::V::DT:T:H::D::RS:::A::DR::F::::::::Q::::T:::L::::::::: hla1827 S::::::GD::::::A:::::M::E:::::::V:AA:::::::::::::::::::::::: NP1580A :A:R::V:::V:::::::::R:::::::DV:D:::::::::::D::T::::::::::::: HQ1525A SG:::I::N:R::::A::::::::E::::RT::RDP:::V:T:::::::::::::::::: HVO_1412 :::::::G::::E:::::::Q::::R::::::F:::::::::::::::::::::A::::: Hbo0134 S::T:::G::::T:::::::::::E:::S::D:::A:::::::::::::::::::::::: rrnAC1489 EV::::::::T:T:::::::::::::::D::::::G::F::A:N::T::::::::::::: Hmu1740 :A:E::::::P:E:::::::A:::::::::::::::::F::::T::T:::::::A::::: consensus AAMALVEAAGLDLTRPEISTVARRGSSSAARAVTGAFSHLYAGMNDADCRSERIET---- #oth 1.3.122..212122.21..1.....3....1...11.3.43.21.3..212.1122211 Hut1381 L:T::::::::::S::::::I:::::T::::::::G::D:R::S:::::::K:LDV:::: VNG0593 ::L:C:R::::::DL:TV::::::::A::::::::G::D:H::L:::::::::LDAPA:: hla1827 ::L::T::::::::L:D::::::::::::::S::::Y:R:D::L::E::::H:LDVGVGD NP1580A ::V::::::::E:SH:::::::::::::::::::::::Q::T:LD::::Y:::LD::::: HQ1525A ::::::T:::EE::H:::::I:::::::::::::::::Q::S::::T::HA::::::::: HVO_1412 :::::A:::D::M::::V::I:::::A::::::::::::::S::::T::::::::::::: Hbo0134 :::::A:::E:GMS::::::I::::::::::::::::::::S::::E::::::::::::: rrnAC1489 ::::::::::::M:::::::::::::::::::::::::::RT::::R::::::::::::: Hmu1740 ::::::::::::M::::V::::::::C::::::::G::::KN:::::::::::::::::: consensus ---DLEDDLRIVAAHVPAYKETEEAHKEAADSHMFEARLAHVHEQIAEMRDALRAGDFDR #oth 111222321.2.2131.11.1..3..3...3...123.2..115.133111.24421.21 Hut1381 :::P::::V:::G:VI:::::::A::E:::E:::::G::::::::L:D:::::GR:::E: VNG0593 :::EFAS:::::VGE::::::::S::A::::::::D::::::QG:L::::::V:::::Q: hla1827 DGF:P:E:::::::::::::::::::R:::A:::MQ::T:::QD:LV::T::::E::::: NP1580A ::::::::::T:::EI::F:H::::::::::::::::::::I:::::T::N:::EN:::: HQ1525A :::::DATV:T:::::::::::::::R:::Q::::D:::::::H::DA:::::YNA:::: HVO_1412 :::::::::::::::::::::::Q::A::::::::Q::M::I:A::DD:::::YD::::A Hbo0134 :::E:::E::T::::::::::::Q:::::::::::Q::M::::H:LD::::::H:A:::: rrnAC1489 :::::::::::::GM::S::::::::::::E:::::S:M::I:S::SD:::::YD::::A Hmu1740 :::E::E:::V::GM::S:::::A::E:::A:::::N:M::I:G::::A:::IA::A::: consensus VFELAEHDSLSLAATTMTGPAGWVYWQPETIAVFNAVRELRE-EGVPVYFSTDTGASVYV #oth 4122..1.1...1.1.....1.....1.31121.11..3..34131.1...2....11.1 Hut1381 S::I::::T:::::::::::S::::::::SLE::ET::D::D:D:::::::G:::::I:: VNG0593 :::T::::::::::::::::S:::::K:::LSI:ET:::::A:D:::T::::::::T::: hla1827 ICGT::::::::T::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP1580A ::::::::::::::::::::::::::::::LS::ET::T:::DDDI:::::::::::::: HQ1525A I:::::::::::T:A:::::::::::::Q::::::T::::::R:SI:::::::::::::: HVO_1412 A:::::::::::::::::::::::::::R:::::::::K::NE:D::::::::::::::I Hbo0134 A:::::::::::T:::::::::::::::K::::::::::::DE:EI:::::::::::::: rrnAC1489 ::D:::K:::::::A:::::::::::::R::EI::::::::NT:D::::::V:::::::I Hmu1740 T:::::::::::::::::::::::::::R::EI::::::::::::::::::V:::::::: consensus NTTAEHVDRVEEAIADCGVDTDVWEVGGPAEVLDESEALF #oth ..1141122..321232111.32.4.....431234211. Hut1381 :::::Y:::::S::ETL:IE:LT:R:::::R:R:PEK::: VNG0593 ::::S:A:E::A:V:::::::A::::::::HE:::RD:I: hla1827 ::L:G:AEE:::R::EI:I:::I:::::::HL:::N:::: NP1580A ::::D::::::N:::AL::::R:::::::::::P:::S:: HQ1525A ::::A:::T::S::S:I:I:::I:T:::::T::SA:DS:: HVO_1412 :::E:::::::::V:::::E::::G::::::::::::::: Hbo0134 :::EA:::::::::SA:D::::::G::::::I:::::::: rrnAC1489 :::E:Y:G::::TV:::::::R::D:::::QI:::DK::: Hmu1740 ::::::::::::TV:::::::R::::::::R:::D:::::