| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3709 | rrnAC0955 | Hmu1754 | VNG1353 | HQ1496A | NP2780A | Hut1045 | HVO_0953 | Hbo0495 |
| 1846 | rrnAC0955 | 4174 | 1617 | 1310 | 1148 | 1232 | 1302 | 1297 | 1311 |
| 1788 | Hmu1754 | 1617 | 4054 | 1096 | 1134 | 1253 | 1194 | 1442 | 1312 |
| 1965 | VNG1353 | 1310 | 1096 | 3769 | 1356 | 1470 | 1412 | 1487 | 1377 |
| 2119 | HQ1496A | 1148 | 1134 | 1356 | 4645 | 1463 | 1504 | 1883 | 1975 |
| 2209 | NP2780A | 1232 | 1253 | 1470 | 1463 | 3634 | 1692 | 1730 | 1611 |
| 2167 | Hut1045 | 1302 | 1194 | 1412 | 1504 | 1692 | 3610 | 1663 | 1681 |
| 2642 | HVO_0953 | 1297 | 1442 | 1487 | 1883 | 1730 | 1663 | 4543 | 2312 |
| 2480 | Hbo0495 | 1311 | 1312 | 1377 | 1975 | 1611 | 1681 | 2312 | 4182 |
704 symbols consensus ---MMRLHPLSVPYRALQRSASIGFALIFAGAAGGG-----G--ALGGL--AAVGLAAAV #oth 122343.2.4.2131234434332433523355333511332335433323732334344 rrnAC0955 ::::N::::R:AVLSVARAALQG::FGF:G:SV:T::::::-::-ML::PAF::P:LGLL Hmu1754 ::::N::::I:AVGSVVTGVVRL:SIGF:::MMLT:P::::-::-:DV:PLE::FVL:P: VNG1353 :::-:K:::::::V:::S:ALGF:W:FLIG:::LS:::::::NA::T:V:::VL:VMV:: HQ1496A MTQIRT:S:V:I:::I::::G::A:::::VLSGQ::A::LPELPVI:VVDSTFI:AI:VA NP2780A :::-:K:::F:::L::IESVI:LAWV::I:IL----::::::SP::::T::S:::VIV:A Hut1045 :::-:::D:::I:::IAEN::R::G:IVV::I::S:G::SG:NMLQ:AA::IFL:I::IG HVO_0953 ::::T::S::::::::V::::::A:::A:LAFT::TT::FG:::F::::::G::A:VGV: Hbo0495 :MVTQH:S:::::::V:::GG::VA::G::L:T::FSLPFA:::IT:P:::VL::::SLF consensus VALI-AAYELAYYRRFRYELTADTLDIESGVFSRRNREIPLRRIQNVDISRNVVQRLLGI #oth 43233411241133..4.2.24111223...22.14.1..22.1..1.1312332.2312 rrnAC0955 G::TFGG:A::R:F::::::DG:::TV:::::A:QS:Q:::G:V::L:VEQ:ILN::::L Hmu1754 G::VG:::AV:R:Y::T:A:AGG::SVD::::D:QE:::::G:::::::E:GP::::F:L VNG1353 ::VV:-:::I::::::D::::E:S:::A:::::::E:::::::V::::VT:SL:A::::L HQ1496A IV::FVG::T::V:::Q:K::T:S:::D:::L::::::::::::::::::::II::G:N: NP2780A WFV:AL::Q:I::Q::E:::::::::MA:::I:::R::::IQ:V:::::::::L::AF:V Hut1045 :::V::GW:I::H:::::::::::F::::::::::D::::Y::::::::RQ::::::::: HVO_0953 :VA:::G:::::F:::E::::P:::::R::::::::::::Y::::::::::::A:::V:: Hbo0495 AIAL:V:::F::::::T:::::::F:::::::A::::::::G:::::::::::I::AM:: consensus AVVRFETAGGGSTEASLRFVSREEAKRLQSEVGRLKR----------------------- #oth .4142.....33..14.32.2521142114322232234433343223111111111111 rrnAC0955 :I::::::::SA:::T:DA:DEA:V:::RNY:RTHD:DEAAESAAETAGAVSGTATSGRS Hmu1754 :::K::::::SA:::V:NA:DVD::RA:::A:AQYR:EGDETASDEDE:::::::::::: VNG1353 :::DV::::::::::::::::::A:AD::AD:RTRRTTPGDAADAATA:::::::::::: HQ1496A :::S::::::E::::T:::::A:::::::R::::R:HDKSDTRTSETV:::::::::::: NP2780A :QINL:::::S:::::::Y::V:::Q:::::I:::::::::::::::::::::::::::: Hut1045 :E::L::::::Q:::Q:SY:N::::G:::E::::H::::::::::::::::::::::::: HVO_0953 :A:DL::::::E::G::::::Y:::R:V::::A::::::::::::::::::::::::::: Hbo0495 :A:S::::::TE:::K:::::F:::::::R:L:::::::::::::::::::::::::::: consensus ---------------------------GASDDEAEDADDPE---------QELLFALTPR #oth 111111111111111111132332222355355425344261111111113341142362 rrnAC0955 AHADLPGVTGPTPAHTGDAQTANDFEDS::ASDT:PR:Q:D:::::::::GS::::FDQ: Hmu1754 :::::::::::::::::::::::::::P:H:TV:REPTG:G::::::::::RRIYE:ST: VNG1353 :::::::::::::::::::ATPDA::::GA:S:SRS:A:RAREPTPVGERG::::::SN: HQ1496A :::::::::::::::::::DSSEDDQT:NK:ETSGGSP:RT:::::::::VNE::V:DDG NP2780A ::::::::::::::::::::::::::::QTQR:::RSAE:::::::::::::-::SI:SK Hut1045 :::::::::::::::::::::::::::ADEP:AG:E:::HS:::::::::A:T:YSI::: HVO_0953 ::::::::::::::::::::::::::::GT:---G::SE::::::::::::::::E:::: Hbo0495 ::::::::::::::::::::::::::::E:A:--::::T:V:::::::::A:E::K:EG: consensus ELGILGLVSFDLRLPGLVLA-----------LGPAA---------LPSLRSLFAVPSDVG #oth 1.2221421322123443433224222222223355433221222423365555615542 rrnAC0955 ::LTYA:::VRPAA:V:T::SLPLGMDVVWAVLRFNATLVGASLNG:VI:W:ASS:ESTR Hmu1754 D:LT:A::::RPAA:AV::FGVPFAQEYALR:LS:TVETLG::::G::TV::SGL:TYST VNG1353 D:LLY::L::NP::FSGII::::::::::::VATV::::::::::A:::GGRM:::-::: HQ1496A ::ALV:FF:I:::V:::LV:GLST::::::::::ILTGLVPAASP:R::LTVIGG::VLT NP2780A :::L::V:GI::::LSF:TV::::::::::::L:VV:::::::::S::::EQ::D:-L:: Hut1045 ::::::I::M::::VP:::VALSV:::::::F::::ITSV:::::::EIDQW:LIGPL:: HVO_0953 ::A:V:AL::::::::::FV:::::::::::F:STV:::::::::F:IVA:YVD::VPA: Hbo0495 ::::::AL:::F:V::IIFL:::::::::::FFSGS::::::::::TVVT:::--:::L: consensus GVVLAGLGAVALLLLVALVSW---AAIAVVNYYGFRLTRVGDELRYERGLLQRYSGSIPL #oth 53362532434534335342134231432431.1.2.64541112.....22122.3..2 rrnAC0955 L::F:AISL:QF:::ALV::-:::V:LT:IE:::::::QADGD::::::::R::::N::: Hmu1754 :ET:LTV:VA:A:F--::AA:LLS::FTITE::::H:DY:::D:::::::I:Q::::::: VNG1353 M:::V-A:::::A:G:W:::-:::::VR::QF:::::R:::GD:::::::FE:RD:T::: HQ1496A :G:N:L::LLPV:IG:VVL::LVG::S::TS:::::::ETRG::::::::F:::D::::F NP2780A LA:T:P:A:A:IVVVT:GI:-:::GIL::M:::::::A:QN:::L::::::::F::A::: Hut1045 FGSIV::AILS----------:::GI:SMLQ::D:Q:GTH:::Y:::::::::::::::V HVO_0953 SAAA::V:I:::V::::::::AAGF:S::::::::::S::::::Q:::::::::N::::: Hbo0495 P::VV-::TFV:::::I:A::ITG::::I::::::::VQSA:::Q:::::::::D::::F consensus EKVQTLTVRDNPLKRRFGYATLAVETAGYAPG-------QGSGRGSEAAIPLAPRDRVLE #oth 2.2..111312312.3411.2.31.....1111111222334343133.1.116.23154 rrnAC0955 :::::V:I:E:V:M:::::::::::::::SG::::::::-NQQSTQGV:V:::::EE:Y: Hmu1754 :::::V:::E:L:M:QV:::A::::::::::::::::::S::QDA:NT::::DD:ET::A VNG1353 S:L::VS:E:SV:M::Y:F:S:::::::::::::::::::SPSG:::::V:I:::AA:F: HQ1496A ::I:::::E:D::::Y::::::Y::::::::::::::QSGSG:::::V:V:::Q:::ID: NP2780A S:::::::SE:FIA::LR::S::::::::::::::::::---D::::S:::::K::::FN Hut1045 ::::::SI:E:V:A:WL:::S:TI:::::::::::::::::::AR:QS:::I:E::::V: HVO_0953 D:L:::::E:::::::::::::L::::::::SSDGTNGSG:G:::::::::::T:::::G Hbo0495 D::::::IA::::::WA:::::L:::::::::::::QGDS::S::::::V:I:S:E:IED consensus LARDIEPVGDPDFERPPKRARRRYAVRYSLVAGVATAVLYAVDRLVDLTFPWYAPLALLP #oth 1254213245332411.3.312..33.231353332333452343555442.23423131 rrnAC0955 :::::::F::L::D::::::::::LA:F::A:AGL:::A::::S::LA:GY:WLAAL:FL Hmu1754 V:EALTDADV:AM::L:D:S::::::::::LPV:::GL:LS::T::QTVPY::::::::: VNG1353 :::E::::A:I:LS:::E::QD::VR::A:AGLGVV:AGAL:S:::-VS:::::LAV:V: HQ1496A :IKR::::DTIELR::::::::::L::AG:IV:AVIIG::TISTVMSI::::WVAIG::: NP2780A ::QSV:DFT:VE:T:::::::E:::G:::II:LI:VI:AFGA:AYT::::A:::T:::F: Hut1045 :::S::SF:EVT:::::::::E::::::L:::L:II:GT:::TFHP:VSG:::FSAVI:L HVO_0953 :VA:L:G:EL:T::G::T:I:::::::::::L::::LA::GA:::LPQEI::FV::::V: Hbo0495 :VN::::::S:::R:::::T::::FG:::I:I:A:::::SVAGSVAS:GL::::::::I: consensus VAAVAAHLKWRHRGYALDEDHIVTRNGFWRRETRIVPYYRVQTVIDSRTVFQRRRRLATV #oth 3333113451321.443534342113.224.4123..31.2...243112....241212 rrnAC0955 PVVP:::FR:::::FD::GSVLA::S:::::T::::::::L:::FVT:SP:::::D:::: Hmu1754 :T:L:G::S:K:::F::LDHLFA::S:VLV:S::L:::::::::::T:::::::LS::S: VNG1353 L:VP::RRAHAT::VYS:S::V::QA:W:::K:TV::AH:::::LRKQ::::::WA:TS: HQ1496A :GGII:IAL:::::HWIS::YF:::::VFT:::::::L::I:::::T:::::::LG:::I NP2780A L:::::::::LNL::DVQSEY::L:E:::T:TITV:::::::::L::Q:::::::::::L Hut1045 IVP::::Y:::::::H:G::YAL::::::S:RIT:::T::::::LS:::I::::::::S: HVO_0953 ::V::GA:Q::::::::T:::::::::::K::::F::::::::::ER::I::::W:VS:: Hbo0495 :::::::Y::K:::LW:G:N:V:::::VLK:::K::::::I::::::::I::::L::::: consensus TADTAGSSSLGGGDARAVDIDADRADELREELADRLQEAVAARREGRR------------ #oth 32...1141.51432415.22544.43122314321454345325443222222222322 rrnAC0955 G::::S::::L::V::VY:::E:T:K:::DT:R:::TAH::GL:T:D::::::::::::: Hmu1754 :::::STA::L::::T:H:L:DQ::RTVH:T:RE::---M:DL:A:E::::::::::::: VNG1353 VI:::::R::S::G:V:I:R:GGD::A:ADDVV:CTLLS:GV:-----:::::::::::: HQ1496A I::::::R::::S::Q::::S:Q::TT::T::ET:::R:IHV:KDRLGSMSTTGVSSSKS NP2780A VV::::::G:TNRQP::L:::EE::A:::::V::K:::M::Y:::E:::::::::::::: Hut1045 IV::::::::M:T::V:A::::EQ::R:::AV:::::V:I--------:::::::::::: HVO_0953 :::::::I::V::::T::::EVTD:A::::T:N:::R::LS::::A:QQSRQAALGIRAA Hbo0495 :I:::::L::::Q:VA:::::T:Y:::::D::ES::RV::::H:Q::-::::::VGIGA: consensus -------------------------------------GDADAS-TADLDDADDN------ #oth 221332333222332322312122222111111111123235463345333332434322 rrnAC0955 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::-:----------:::::: Hmu1754 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::RRQGL::L::E::APDGAVDA VNG1353 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::DT:AAGSAA:-----:::::: HQ1496A SSDTVANNKDTIVTTESDNDGSKSQVT::::::::::DTD:N:T:H:N:QPA::HNHNDN NP2780A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::EERVE:M::E:A:::P:PGV::: Hut1045 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::QR:S::----------:::::: HVO_0953 EPDRDADASDSVAVTDAEADVSQTPEFVEEAEPAAAG:::::EDA::TG:T:::ADTDDA Hbo0495 ::DDELSVTESVEQSKSEQD::::::::::::::::::T::TAH-S:P:::V::A:ADGA consensus -------------------------------------------- #oth 44324234433432121111111111222332223212222222 rrnAC0955 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu1754 GTPDPTESSAREP::::::::::::::::::::::::::::::: VNG1353 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ1496A YGGDDDGTEETRRS:::::::::::ENETNDISNPESGSTEESE NP2780A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut1045 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0953 AADDADEPAETDDPFIWGESVESEGEDDEDADDPEESSDERDAI Hbo0495 TDGPSDDATDDADPFVW::::::::::DTASDDNSK::::::::