| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2346 | NP1752A | HQ1381A | HQ2596A | hla0171 | VNG2084 | HVO_0445 | Hbo1062 |
| 772 | NP1752A | 2061 | 634 | 601 | 535 | 659 | 645 | 603 |
| 1199 | HQ1381A | 634 | 2428 | 906 | 943 | 944 | 965 | 963 |
| 1451 | HQ2596A | 601 | 906 | 2457 | 1015 | 1160 | 1278 | 1287 |
| 1468 | hla0171 | 535 | 943 | 1015 | 2895 | 1139 | 1258 | 1246 |
| 1638 | VNG2084 | 659 | 944 | 1160 | 1139 | 2446 | 1415 | 1421 |
| 1935 | HVO_0445 | 645 | 965 | 1278 | 1258 | 1415 | 2407 | 2203 |
| 1933 | Hbo1062 | 603 | 963 | 1287 | 1246 | 1421 | 2203 | 2401 |
414 symbols consensus -------------------------MSTQT-------------------DRIEEALARIR #oth 111111111111111111111111112254222222222332232233223233516213 NP1752A ::::::::::::::::::::::::::TDP-::::::::::::::::::::SVD:E::::Q HQ1381A ::::::::::::::::::::::::::::--::::::::::::::::::::TVD:I:S::E HQ2596A :::::::::::::::::::::::::::S:SSDSRLRDLLQYFGLASVGDSSV:KK:TDL: hla0171 MTATATRRPTRSRRRDENGADLRVTKD:T:SDGTAGSGAIDDADGSGVPN::A:QFEN:K VNG2084 ::::::::::::::::::::::::::::KPNEG::::LLARFGFGVDPD:KY:AR:Y::K HVO_0445 ::::::::::::::::::::::::::::D::::::::::::::::::::::::D::RN:Q Hbo1062 :::::::::::::::::::::::::::::G::::::::::::::::::::::QD::KN:: consensus RAKRVRRLFW--AVALVAFAILFANA-LGAVGFSLLEIFAYWPQFTEALGDFFPPTSLFG #oth 143331324333313333214424532143232323334234341433.43222333221 NP1752A :QWQR:MVVRAV:::A:VA:VVA:GRW:---::D:GYLY:HRQNLQDI:LE--------- HQ1381A ::VLI::I::SI::T:AVG::Y:GTGF:::RPVPE:LR::QFEF:AAE:IKYVQ:N---- HQ2596A :R:T::::YA::GLGI:IA::V:NAS::N::::::T:L::QI::::::::EY::::TYY: hla0171 :TR:R:A:G:TGLL:FL:::T:Q:F::----ATE::NPD:RLET:::S:TG:::I:NY:: VNG2084 :NRTKN:II::::L::I::LV::EV:::EL:N::::::S:::S::VGS:R::::L::::: HVO_0445 I:::::L::S::I:V::L::WF:T::::SE::::IG::VE:::E::D::::::::GT::: Hbo1062 I:::::L::S::L:VF:L::FI:T:::::E::::IS::VK:::E:S:::::::::G:::: consensus VIPFVDLGQYWA-------------FIAARNLLAQFQ-GNP------------------- #oth 121131343144111111111111122443324445353333311111111111111111 NP1752A -----------E:::::::::::::ML:P:A:W::L:GDA:TL::::::::::::::::: HQ1381A ---::::TF:TQNNNINGLAAIIASVTHPGSIVTTISSLRSSL::::::::::::::::: HQ2596A -:::I:FM:::N:::::::::::::::I:E::F:AS::---::::::::::::::::::: hla0171 ::::L:F:::IQ:::::::::::::::RQE:::YDPEI:RLLFQFPPNPTDIYVFFFQEL VNG2084 :V::::V:::YS::::::::::::::L::HE------:-::SI::::::::::::::::: HVO_0445 ::::::VS:::::::::::::::::::QE::::L:::D:::::::::::::::::::::: Hbo1062 ::::::::E::::::::::::::::::QD::::LT:EN:::::::::::::::::::::: consensus ----ILGAV-ETLAIGFVGTVLGIPGALLFGVLGSERVTPFPFNFIFRGTMSVIRAIPAL #oth 11114432333.221131..21.3.2.151.211111.1.2121131.221151.11.12 NP1752A ::::LPA::::::::AG:::AI:L:L:FAL:::AAGN:::RYVSTPA:LFLGTL::V:SM HQ1381A :::::IS::VM::T::A:::I::F:F::F::::::::::::::::V:::V::A::::::: HQ2596A ::::-----:I:I::AIA::I::L:::::::IMA::::V:Y::::V::A:::L::::::: hla0171 GIFQ:F:EAGI:::M::::::::F:F::V::T::::::::::::::::::::F::::::I VNG2084 ::::P:A::::::G:A:A:::::A:L::T:::::::::::::L::L:::V::S::S:::: HVO_0445 ::::V::::FV:F:M:::::::::::::IL::::::::::Y::::::::::::::::::: Hbo1062 ::::V:::MFV:F:M::A:::::::::::L::::::::::Y::::::::::::::S:::: consensus VWALIFIPLGGLSPFTATLAIATDTIGNLGRLFTDELEEVEDGPIEAIESTGANRPQIVV #oth 1121122213112132121.1231.3.2.....2.1...1211.1.12311..2431325 NP1752A :Y::L:VI:A::GAVAG:::::VG:V:D:::::A::::::DET:A::VS:A::GVAATTA HQ1381A ::VF:YAA:VP:::L::M::V::::V:::::::::::::ID:::::::R::::S:V:VIN HQ2596A ::V::L:::::VT::::::::MI::T:Y:::::::::::IA:::::G:Q:::::KS:::S hla0171 I:T:::::FL::G:AS:AI:::F::::::::::V:::::I:::::::MRT:::SK::::F VNG2084 :::::::::::::::::::::G:::::::::::::A::::::::::GV:::::S:::VIL HVO_0445 :::::Y:::::V:::::::::G:::M:::::::::A::::::::::::::::::S::K:: Hbo1062 :::::Y:::::V:::::::::G:::M:::::::::A::::::::::::::::::G::K:: consensus FGMLSQVFTPFIAWTLYILEINVRIAVTLGLIGAGGLGQVLQTQRNLFRYTNMMATILVI #oth 111.1.142311..22121.2.2.22232.2111..1.3414523422432221.31232 NP1752A AAR:P::T:AY:::::FY::L:A:KSSV::IV::::I:YP:IMAFRARN::RV::A:V:: HQ1381A :::::::SSS:V::::::::::T:::IS::VV:::::::YI:QNL:::NSFRAG:GLVTL HQ2596A ::::::::RQ::::IAFD::H:::V:IG::::::::::LE:DI::KT:H::E:::C::LV hla0171 :::::::R:A::::::::F::::::G::V:V:::::::Y::TS:Q::L:F:E::::L:A: VNG2084 ::::::MVR:::::SM::::::::V:::M:::N:::I:EI:ML::QTRSWH::::::I:: HVO_0445 :::::::::::::::M:::::::::G::M::::G:::::::::::G:::::::::::::: Hbo1062 :::::::::::::::M::::::::::::M::::G:::::::::::G::K::::::::::: consensus FLLVVSVELLSQRLRSRLRGNE--EETSILELIV----EFPQRMARSMT----- #oth 24.2311.3212.2.221143221343243433422114314144534451111 NP1752A LC:::G::T:AN:::GW:DAE-::----------::::RNAS:------::::: HQ1381A LI::L:I::::S:::A:::PS:H:DAKGLVQS:REL::GD:D:WLGRT:D:::: HQ2596A V::AG::::::::V::Y::DDDEV:::G:::A:I::::TA:KKIITATAGRRER hla0171 :::II::::F:::::::::SDD::V:M::W::VT::::G::R:::D::LK:::: VNG2084 :V::::::M::::I:::I:::-:::S::V:R:F:RTIKQ::SKTREAL:::::: HVO_0445 :M::::::FV:::V::YI:::::::G::L:K::::::::::::::::IWE:::: Hbo1062 :V::::::FV:::V::YI:::::::G::F:K:::::::::::::::::WQ::::