|
Pairwise sequence scores | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3876 | HVO_2032 | Hmu0685 | HQ2451A | VNG0901 | hla1843 | HVO_1400 | Hbo0149 |
2640 | HVO_2032 | 3868 | 2707 | 2243 | 2400 | 2237 | 2361 | 2290 |
2801 | Hmu0685 | 2707 | 3830 | 2377 | 2403 | 2420 | 2418 | 2450 |
2982 | HQ2451A | 2243 | 2377 | 3937 | 2548 | 2651 | 2652 | 2654 |
3039 | VNG0901 | 2400 | 2403 | 2548 | 3756 | 2629 | 2691 | 2745 |
3092 | hla1843 | 2237 | 2420 | 2651 | 2629 | 4138 | 2863 | 2885 |
3201 | HVO_1400 | 2361 | 2418 | 2652 | 2691 | 2863 | 3908 | 2998 |
3240 | Hbo0149 | 2290 | 2450 | 2654 | 2745 | 2885 | 2998 | 3954 |
557 symbols consensus ----MATAVHLDGITKRFPGVVANDDVDLTVERGTVHALLGENGAGKTTLMNVLYGLYEP #oth 1222351113123.....11.1...31212122.11..12...........11.....2. HVO_2032 MTDTT:P::Q:TD:::::GD:::::S::::LD::SI::VI::::::::::::::::::D: Hmu0685 MSGSG:P::E::A:::::GD:::::G::::L::::::::V:::::::::::S:::::::: HQ2451A :::::E:::::::::::::D:::::NIEFE:KQ::::::::::::::::::::::::::: VNG0901 ::::-M:SIS:S:::::::::::::::T::::E::::::::::::::::::::::::::: hla1843 :::::NP:::M::::::::::::::::::A::::S::::::::::::::::::::::::: HVO_1400 :::::S::::::E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I::::::: Hbo0149 :::::T:::::::::::::::I::::::::::::::::::::::::::::::::::::R: consensus TEGTVAVDGEPRDFDSPRDAIDAGIGMIHQHFMLVDPMTVAENIVLGNEPRKWRGLAVDR #oth 21.12622.3114.1..2...2..1.......1...3...41.11..1..3213.13..2 HVO_2032 N:::M:::::::S::::::::A::::::::::Q:::N:::LQ:::::H::ST-:::-::E Hmu0685 D:::IR:::Q::T:::::::::::V:::::::Q:::T:::LQ:V:::H::TD-N::-::Q HQ2451A :S:R:E:A::E:::::::::::::::::::::::::::::V:::T::::::::G:::::: VNG0901 D::::S:::TE:A:::::::::::::::::::::::S::::::V::::::::::::R::: hla1843 :::::FL::::QS:::::::::::V:::::::::::::::W::V::::::KT:G::R::E HVO_1400 :::::H:::K:::::::A:::::::::::::::::::::::::::::::::::F:TT::: Hbo0149 :::R:VIE:TE:K:S::K:::K::V:::::::::::::::T::::::::::::F:::::: consensus EAARAAVDDLCDRYGFDVDP--DARIEDVSVGVQQRVEILKALYRGADTLILDEPTAVLT #oth 43..431422241...111211323111211.2..1...1.2......2........... HVO_2032 Q:::RRIT:I::T:::S::EHL:TP::ELGL:I::H:::V:S:::::::::::::::::: Hmu0685 DS::::I:EV:ST::::I:KHL:T::::LG:::::::::V:S:::::::::::::::::: HQ2451A T:::K::VEIAG:::::I::::N:::::I:::E::::::::::::::::::::::::::: VNG0901 ::::::::::::::::::::::T::VA:::::::::::::::::::::V::::::::::: hla1843 A:::E::VE:SE::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::::::::: HVO_1400 :R::QE:I::SN::::::N::::DA:::::::::::::::::::::::I::::::::::: Hbo0149 :G::RD:QA:S:::::::::::E:T::::::::::::::::T::::::I::::::::::: consensus PQEVEDLFDVLEELTAQGKTIIFITHKLGEAMHAADDITVLRDGKNVGTVDAADTTREEL #oth ...122.13.221..23.111...1...1..131..11....1.44.111333411323. HVO_2032 :::::G::::M:A:::D:RSL:::::::D:::::::::::::::SA:::::::A:SQN:: Hmu0685 ::::DE::::MA:::DR:RSL:::::::D:::AV::::::::::ES:::::G:S:SEQ:: HQ2451A :::IKE::G:::::::::::::::::::::::R:::E:::::::QR:D::::GT:::NA: VNG0901 ::::D:::E::G::::E::::::::::::::L:::::V:::::::T::ALPT:::::::: hla1843 :::::::YG:F::::E::::::::S::::::LS:::E:::::::V:::::AS::V:::D: HVO_1400 :::::E::R:F:::::::::::::S:::::::::::::::::N:::::::K:DE:SN::: Hbo0149 :::::::::::::::D:::::::::::::::::::::V::::::::::::KTE:::::Q: consensus AELMVGREVLLEIDARPQEPGDVVLSVDDLRVDDDRGVEAVSDVSFEVRAGEVLGIAGVD #oth .11.1..1.12143454321.332131551414.31.333.321124212..12.....1 HVO_2032 :RM:::::::FDV:S:GGT::E:A:T::GVT:R:E::L:Q:R:::LS::E::I::::::E Hmu0685 :RM::::D::F:GQE:TT:::S:T:D:A::::Q::::L:Q::GIDLS::S:::::::::: HQ2451A ::::I::::::D::RPST:T:G::A::S::V:::::::R::DT:D:::C:::I::::::: VNG0901 :::::::::::D:::DAGT:::T::D::S:T:T:GD:IDR:A:::MR::::::Y:::::: hla1843 ::M:::::::M:PATT::K:::R::E:TEVHA:::::::T::GI:::L:::::F:::::: HVO_1400 ::::::::::::PK:E::::::E::::QR:SAT:N:::P:::::::DI:E:::F:::::: Hbo0149 :::::::::F::T:TN:M::::::::TNN::AE:N::M::::::::T::E:::F:::::: consensus GNGQSELVEAITGLRTPEDGSVTYLGRDITDASRRDRIEAGMAYIPEDRQERGLVMDFDL #oth ....21.1.2...114125.2122412221251.151.13.2111.1..221.1.1221. HVO_2032 ::::Q::I:::::M::::R:T:SLQ:::::EL:::R:::D:VS:V:G::L:E:::Q:YS: Hmu0685 ::::A::::::::::SV:S:A::FE:::::ET:::::::S:I::::::::TE:::QEY:: HQ2451A :::::::I:::::::A::T:TIRL:DENV::N:::Q::::::::::::::D::V:::::: VNG0901 ::::A::::::::::V:DA:A::FD:E:V:QR:::HH:::::::V::::H:::::::S:: hla1843 :::::Q:::T:::MHN:T:::I::::EPMA:E:::EH:DR:::F::::::::::::SY:: HVO_1400 :::::Q:::::::::::TE::IS:K::::::::::S::DD::::V::::H:::::::::: Hbo0149 :::::::I:S:::::::T::::::::S:::::P:S:::D::::::::::H:::::::::: consensus VRNGILGSQHSPPFAEGGRIDWDAAREHAEEIIDEYDVRPPNADADAESLSGGNQQKFIV #oth 14.11.11.2442.4442221.46413.1451133...11132114.3.1........11 HVO_2032 :::AL:SN:TMDA:SD:LFL::QRIGD::D:::EA:::::R:PE:T:K:::::::::::: Hmu0685 :::AL::N:TIE::V:N:FV:::LV::::A::VA::::Q::HVE:::G::::::::::V: HQ2451A :G:AL::::::SQ:QSS::::::KT::::KT::N:::::T:G::TS:A:::::::::::: VNG0901 :A:::::::RA:A:TT:S::::QS::T::TDV::T:::::RD:::T:A:::::::::::: hla1843 TE::::::::D::::::::L::R:S:D:::SV:EQ::::::::::E:::::::::::::: HVO_1400 :Q:::::::::::::AA:::H:SD::::T:R::::::::::H:::::::F:::::::::: Hbo0149 :Q:::::::::K::::R:N:::GTT:R:::A:::::::::::P::N:::::::::::::A consensus GREFERDPDLVVAMHPTRGVDIGSIEFIHERLLELRDEGKAVLLVSSKLDEVQGLSDRLA #oth ...1111.221.131......1.12..113.1211.32.4.1..1....1..12....11 HVO_2032 :::L::::SVL::A:::::::::::::::Q:FQDM:A::V:I:::::::::::K::::T: Hmu0685 :::LRH:::::::S:::::::::::::::G::H:M::::M:I:::::::::::K:::::: HQ2451A ::::::::EF:::SN::::::V::::::::::::::EA:A:::::::::K:::::::::: VNG0901 ::::::::::::V:::::::::::T:::R::::::::::T::::::::::::TS:::::: hla1843 ::::::::E:::::::::::::::T::L:D::::::T::::::::::::::::::::::: HVO_1400 :::::::::F:::T:::::::::AM::::::::D::A::::I::I::::::::::::::G Hbo0149 ::::::N:E::::T::::::::::T::::D:::::::S:::::::::::::::::::::: consensus VMHEGEFMDVVDPDTVTEEELGLLMAGE-----------------HPDAADGAERR-EGD #oth .211.22314...3411.211......211111111111111111513444443465442 HVO_2032 ::Y::SVV:T::::D::::::::::::R:::::::::::::::::AR:GTER:A:GA::: Hmu0685 :I:::::V::::::A:::G::::::::R:::::::::::::::::ERA::::GVE::--- HQ2451A ::Y::::I:L:::T:T::S::::::::Q:::::::::::::::::Q::DTG:D::EG:S: VNG0901 :LY::RV::E:::::::::A:::::::Q:::::::::::::::::::EEQ------:--- hla1843 :I:::::TG::::A::::::I:::::::TLDDDSVEGAAVHNAGPD:VGNG:V:TDTGT: HVO_1400 :::D::L::I:::RNT::::I::::::::::::::::::::::::R:::GATDAEPPV:: Hbo0149 :::D::::::::::V:S:::I::::::::::::::::::::::::::ET::A::ASDAVA consensus A---------------- #oth 33333113333212111 HVO_2032 ::::::::::::::::: Hmu0685 -:::::::::::::::: HQ2451A LTEDPTDVTTGGERV:: VNG0901 -:::::::::::::::: hla1843 DTLEKTDDDIENEEVDA HVO_1400 :K::::::::::::::: Hbo0149 DGGAGTDGGDQ::::::