Home |  Text search
[S] (-) COG4711 Predicted membrane protein
7 genomes BUD1159 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG2399

rrnAC1176

rrnAC2576

HVO_0018

Hbo1478

Hmu2738

Hut2970

hla0557

- -

Pairwise sequence scores
Consensus score1031 VNG2399 rrnAC1176 HVO_0018 Hbo1478 hla0557 Hut2970 rrnAC2576 Hmu2738
699VNG2399 1021 560 548 547 535 599 625 619
673rrnAC1176 560 1028 550 583 545 609 621 615
804HVO_0018 548 550 1084 859 655 633 657 691
767Hbo1478 547 583 859 1091 660 639 616 628
728hla0557 535 545 655 660 1121 642 661 672
746Hut2970 599 609 633 639 642 1026 672 712
819rrnAC2576 625 621 657 616 661 672 1066 846
843Hmu2738 619 615 691 628 672 712 846 1062

163 symbols
consensus       -----------MVRR-RYALADTAQQIVGGFLLAGPFVVTEEVWVLAANMSWAHALLTVG
#oth            111111111221522222231.11..3...1..1......1...4..53.3441333224
VNG2399         ::::::::::::SGN::::Y:::V::V:::V:::::::::::::L::SR:Q:Y:SIIV::
rrnAC1176       ::::::::::::KE:QKHK::::::::::::::S::::::Q:::A::L::TVF:NVFL:C
HVO_0018        :::::::::MVG:::::F::::::::V::::::::::::::::::::RS::F:Q::::LI
Hbo1478         :::::::::MVG:::::F::S:::::::::::::::::::::::S:::S::AVQGVF::V
hla0557         MPLRSGMKRPRGL::PNFRI::S:::A:::::::::::::::::::::G:NVGQGA::A:
Hut2970         :::::::::::::GPP::K:::::::::::::::::::::::::T::DG:::F:G:A:AV
rrnAC2576       ::::::::::::G:::::RV::::::L::::::::::::::::::::E::::Y::V:V::
Hmu2738         ::::::::::::A:PP::RI::S:::L:::::::::::::::::::::::TY:::::V:A

consensus       IVAAIGYGALYKADDDRDPDREAEVAGVPVRFVSLMLVAFGSVAILALAFTAPGTFLSEL
#oth            2.231..21..4..41..112.2223.2.3..2.125.111..43.12222..42.1535
VNG2399         V::::::S:::T:::G:::::::D:V::::::::::V:S::::LA:SVVL:::T::AA::
rrnAC1176       ::::::::G::G::N::::R:::A::::::::I:VL:::::::GT::I:V:::DQ::G::
HVO_0018        ::L:V:::::::::-:::::::R::G:I::::I::IS:SYL::F::::::D:::::::DV
Hbo1478         ::LTV:::::::::-:::::::RDLL:::::::::I:::YL::L::::::D:::::::DM
hla0557         L::L:::A:::R::T:::::V:K:I::I:A::::::I::::::TL:::L:D::::::I:E
Hut2970         L::V:::::::Q::::::::T::::::L:L::L::IS:::::::L::ILLN::AS::EGM
rrnAC2576       ::F:::::::::::A:::V:T::::::I::::::::C::::::::::V:::::D:::VNG
Hmu2738         ::F:::::::::::::::::T::::::::I::::::G:S::::::::::L:::Q:::V:A

consensus       ------GVLG--LRMAVLRTTLKAISVGAVFSVVGAATADSVF
#oth            2122224244444633245313113111.2...1..1.1..11
VNG2399         ::::::::GSSVAVVG::AA--::A::S:L:::::::::::LL
rrnAC1176       ::::::----::PLADQMIV:FR:::::::::::::V:T::L:
HVO_0018        SGEVLVS:::YE:DL::::I::::T::::::::I:::::::L:
Hbo1478         TGNGAFT:F:LS:QLD::EV::::T:I::::::I:::::::::
hla0557         ::::::::V:::--VELWT::F:::::::::::::::::::::
Hut2970         :::::::---::-::EQ:EV::RVV::::I:::::::::::::
rrnAC2576       :::::::I:LDPTP:::TL::::::T:::I:::::::::::::
Hmu2738         ::::::EI:PDPT::::A:::V:::::::I:::::::::::::