|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1435 | HVO_2417 | VNG1611 | NP4844A | hla1318 | Hbo2118 | HQ2867A | Hut0419 | rrnAC1735 | Hmu2127 |
990 | HVO_2417 | 1437 | 846 | 731 | 871 | 961 | 935 | 780 | 839 | 836 |
1089 | VNG1611 | 846 | 1430 | 788 | 935 | 976 | 985 | 864 | 940 | 954 |
1015 | NP4844A | 731 | 788 | 1440 | 797 | 836 | 841 | 926 | 979 | 1018 |
1046 | hla1318 | 871 | 935 | 797 | 1426 | 953 | 1008 | 858 | 918 | 953 |
1189 | Hbo2118 | 961 | 976 | 836 | 953 | 1443 | 1157 | 956 | 986 | 970 |
1173 | HQ2867A | 935 | 985 | 841 | 1008 | 1157 | 1430 | 946 | 1002 | 971 |
1075 | Hut0419 | 780 | 864 | 926 | 858 | 956 | 946 | 1426 | 1105 | 1032 |
1174 | rrnAC1735 | 839 | 940 | 979 | 918 | 986 | 1002 | 1105 | 1446 | 1166 |
1162 | Hmu2127 | 836 | 954 | 1018 | 953 | 970 | 971 | 1032 | 1166 | 1459 |
206 symbols consensus --MSTPEEEYYTEERWQNWLDRLEEEELDPENEDSARLLLNLQDDAAIAVAKILTAYEDD #oth 1112312121.141..1..13.221.12.1.31111..12.111.21..21.12313122 HVO_2417 :::TEA::R::SP:::::::T:V:::D::L:S:ETG:::M:I:N:::::I:::::::D:: VNG1611 ::::A::::F:S:::::::::::R:::::::D:::::::::::::V:::A::::N::DSE NP4844A ::::::PG::::A:::N::::::R:::I:::SD:::::FF::L:::T::I::VI:D:::G hla1318 MTDDDAV:TF::D:::::::::::::D:::::::::::::::::::::::V:V:A:LD:E Hbo2118 :::TDA::T:::KD::::::T:V::::::::::::::::::::::::::::::VS:::E: HQ2867A :::TEA::T:::::::::::S:V::::::::::::::::::::::::::I:::VS:F:E: Hut0419 ::::A:PG:::::::::::IQ:I:S:DI:::Q:::::::::::::T:::::::V:D:::G rrnAC1735 ::::::PG::::::::::::::I:::DV:::D:::::::::::::::::::::::D:::G Hmu2127 ::::::PG:::::::::::I:::D:::I:::D:::::::::::::::::::::I:DHD:E consensus EL-DEEAALDELAGVRDIVLAEPDFD----DEEKVMLVDGVQTSLVCVFYAAEEYIAGGP #oth 6313325122.1641121.131232233213.123211111....321111..11123.3 HVO_2417 T::G::E:::::ST:H:::M:::E:ETE::N::AEI::GS:::::S:A:F::::F:VA:: VNG1611 AV:S:SE:V::::DI::V:::::A::::::::D:L:::::::::::A:::S::Q:V:D:V NP4844A :FE:A:::AA:IDNI:A:::E:V:I:::::::::LT::::I::::::AL:::::::V::: hla1318 RI:::DR:VE:IRT:::::::DVE::::::::D::::I::::::::P::::::::VV::V Hbo2118 T::S::D:::::E:::::::S::T:EGDD:V::::::I::::::::::::::::::VA:: HQ2867A D:::QSV:::::ER::E::::::E::AQGGS:D:I::::::::::I::::::::::L::T Hut0419 :::EA::::E::Q:::E:::E:V:IA::::::::L:V::::::::::::F:::::V:::V rrnAC1735 P::::::T::::T:::E:::DDI:I::::::::T:::I:::::::L::::::::FV:E:A Hmu2127 LI::R:T::E:I:DI:A:::E:I:L::::::::T:::I:::::::::::::::::::E:: consensus AE-EAPIEEYIEAAADAEA-EEDLDAALGYCVQAGTRII-DGDELDMDVAEELEYGLVSE #oth 111422363215..22..213112.3..123112..21.13132124432212.1.1.21 HVO_2417 ::L:DDMDA::R::::::::AD:::S::::I::V:::V::::ED::IE:LD:::F:::T: VNG1611 :D:D::VM::VR::VE:::::::::R:::LVAAG:::V:::::::::A:L::V:::::T: NP4844A ::::GT::Q::D:::A:::E:::::T::AH::::::LV::E::DIGL::::DI:::F:AD hla1318 V::-GDVS:FVH::::::::ND::::::::V:::::::::::EA::I:LV:::::::::: Hbo2118 :::A::L:::VT:::E::Q:::NM::::::L:::::::::E::::::SI::::::::::: HQ2867A :::S::LT::V:::::::::D::V::::::L:::::::::A:::::VT:VD:I::::::: Hut0419 :::-:::ADL:A::SE::S:::NM:::::::A:::::::A:EA::PR::VDD::F:::A: rrnAC1735 :D:D:T:TD:::::::::::::::::::::::::::Q:::G:S::P:E:::D:::::::: Hmu2127 ::::GTVID:::::::::::::::::::::::::::LV::::E:::V:A:A::::::::: consensus WVNGLDSLQSAMSDPEVVEEDE---- #oth .2......121211..11.1132121 HVO_2417 ::::::::::GL:E::::::ED:::: VNG1611 :::::::::::L:::::I:DE:SGE: NP4844A ::::::::GR:L::::L:::E-:::: hla1318 :::::::::::IE:::::::EG:::: Hbo2118 :L::::::::::::::::::::E::: HQ2867A :::::::::::::::::::::-:::: Hut0419 :::::::::T:::::::::::DE::: rrnAC1735 :::::::::T::::::::::::S::: Hmu2127 :A:::::::T::::::::::::EGDA